More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1563 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
540 aa  1105    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  46.14 
 
 
541 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  44.1 
 
 
539 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  42.31 
 
 
537 aa  415  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  46.06 
 
 
546 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  41.39 
 
 
542 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  41.39 
 
 
542 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  39.13 
 
 
578 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  37.68 
 
 
549 aa  343  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  37.43 
 
 
597 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  37.67 
 
 
578 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  37.67 
 
 
601 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  36.78 
 
 
558 aa  333  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  35.73 
 
 
552 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  36.17 
 
 
551 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  37.19 
 
 
584 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  36.75 
 
 
549 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  35.74 
 
 
569 aa  319  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  36.53 
 
 
662 aa  319  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 
576 aa  316  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  35.7 
 
 
564 aa  316  7e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  36.05 
 
 
565 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  34.79 
 
 
562 aa  299  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  35.51 
 
 
558 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  49.1 
 
 
336 aa  259  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  41.69 
 
 
520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  49.3 
 
 
277 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  35.89 
 
 
532 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  30.04 
 
 
564 aa  200  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  30.16 
 
 
626 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  44 
 
 
251 aa  186  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  28.89 
 
 
738 aa  183  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.45 
 
 
506 aa  136  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3389  hypothetical protein  33.63 
 
 
297 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  28.78 
 
 
707 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  28.28 
 
 
707 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  24.54 
 
 
487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  29.08 
 
 
494 aa  123  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.01 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.41 
 
 
488 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.22 
 
 
546 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 
521 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  22.66 
 
 
479 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 
485 aa  118  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.73 
 
 
558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  24.48 
 
 
606 aa  117  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  24.48 
 
 
606 aa  117  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.23 
 
 
542 aa  115  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  24.51 
 
 
552 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  30.75 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.23 
 
 
542 aa  114  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.23 
 
 
542 aa  114  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  28.43 
 
 
563 aa  114  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  29.81 
 
 
522 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  25.7 
 
 
515 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  28.13 
 
 
561 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.75 
 
 
539 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.77 
 
 
515 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  26.15 
 
 
516 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  25.95 
 
 
516 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.91 
 
 
547 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.38 
 
 
517 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.64 
 
 
484 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  27.78 
 
 
543 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.17 
 
 
484 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  27 
 
 
522 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.51 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  28.07 
 
 
279 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  30.17 
 
 
252 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  27.1 
 
 
523 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  28.21 
 
 
511 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.15 
 
 
515 aa  97.8  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.4 
 
 
586 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.01 
 
 
553 aa  97.8  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  25.34 
 
 
678 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23.68 
 
 
535 aa  97.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.4 
 
 
462 aa  97.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  27.5 
 
 
522 aa  97.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.68 
 
 
523 aa  96.3  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  26.65 
 
 
482 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.1 
 
 
524 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  25.49 
 
 
598 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  25.43 
 
 
515 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.42 
 
 
518 aa  94  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.13 
 
 
522 aa  94  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  22.93 
 
 
561 aa  93.6  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  36.77 
 
 
564 aa  93.6  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.77 
 
 
534 aa  93.6  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  27.43 
 
 
465 aa  93.2  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.4 
 
 
522 aa  93.2  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  26.02 
 
 
500 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  23.15 
 
 
517 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  26.37 
 
 
862 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  24.06 
 
 
550 aa  90.5  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  22.84 
 
 
504 aa  90.9  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.81 
 
 
547 aa  90.5  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.82 
 
 
534 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  26.3 
 
 
535 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.95 
 
 
523 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  24.18 
 
 
479 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>