More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2866 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  97.06 
 
 		 525 aa  1002    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  100 
 
 		 525 aa  1056    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  47.71 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  41 
 
 		 528 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  41.2 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  40.43 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  47.97 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  49.21 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  49.21 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  48.68 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  43.71 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  47.97 
 
 		 460 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  41.73 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  42.08 
 
 		 534 aa  354  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  45.04 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  45.31 
 
 		 441 aa  353  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  42.41 
 
 		 537 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  42.02 
 
 		 534 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  41.63 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  49.07 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  41.73 
 
 		 534 aa  349  6e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  48.78 
 
 		 459 aa  349  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  50.7 
 
 		 443 aa  348  9e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  41.63 
 
 		 534 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  41.25 
 
 		 534 aa  346  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  48.51 
 
 		 462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  44.9 
 
 		 449 aa  339  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  48.48 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  51.21 
 
 		 343 aa  337  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  48.16 
 
 		 441 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  45.84 
 
 		 445 aa  317  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  48.37 
 
 		 549 aa  316  6e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  48.87 
 
 		 568 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  47.23 
 
 		 474 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  47.84 
 
 		 522 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  46.83 
 
 		 506 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  46.02 
 
 		 550 aa  309  9e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  46.92 
 
 		 532 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  49.55 
 
 		 545 aa  297  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  40.17 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  40.69 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  32.51 
 
 		 544 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  43.5 
 
 		 412 aa  244  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  45.95 
 
 		 299 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  36.89 
 
 		 613 aa  216  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  32.46 
 
 		 665 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  38.78 
 
 		 322 aa  190  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  29.39 
 
 		 475 aa  181  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.9 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.48 
 
 		 462 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  29.71 
 
 		 509 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.4 
 
 		 546 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.12 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.46 
 
 		 521 aa  160  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  29.33 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  25.43 
 
 		 500 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.32 
 
 		 522 aa  151  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  31.71 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  36.62 
 
 		 515 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  23.58 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.57 
 
 		 506 aa  144  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  25.37 
 
 		 552 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  32.49 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  32.49 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.95 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.45 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.75 
 
 		 494 aa  123  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.13 
 
 		 551 aa  123  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  23.38 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.51 
 
 		 540 aa  120  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.89 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.69 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.52 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25.29 
 
 		 558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.41 
 
 		 558 aa  114  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  24.3 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.96 
 
 		 553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  24.55 
 
 		 550 aa  111  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.84 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  24.55 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  23.08 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.62 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.63 
 
 		 539 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 504 aa  107  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  28.03 
 
 		 535 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  22.04 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.99 
 
 		 535 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  35.93 
 
 		 281 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.37 
 
 		 590 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  31.34 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  26.52 
 
 		 272 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>