More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2634 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  100 
 
 
459 aa  941    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  82.49 
 
 
462 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  82.49 
 
 
462 aa  783    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  87.46 
 
 
343 aa  634    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  59.09 
 
 
460 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  59.95 
 
 
474 aa  487  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  56.32 
 
 
449 aa  481  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  52.71 
 
 
443 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  51.92 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  46.95 
 
 
447 aa  435  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  49.55 
 
 
445 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  47.69 
 
 
441 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  47.93 
 
 
441 aa  425  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  49.31 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  48.53 
 
 
445 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  47.17 
 
 
445 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  47.39 
 
 
445 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  48.9 
 
 
528 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  48.9 
 
 
528 aa  363  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  50.13 
 
 
522 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  50.84 
 
 
549 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  49.32 
 
 
525 aa  350  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  48.78 
 
 
525 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  46.41 
 
 
527 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  45.67 
 
 
532 aa  342  8e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  41.69 
 
 
568 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  47.78 
 
 
506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  49.59 
 
 
550 aa  336  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  48.37 
 
 
511 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  47.77 
 
 
545 aa  316  5e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  43.44 
 
 
525 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  42.7 
 
 
534 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  42.7 
 
 
534 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2275  site-specific integrase/recombinase protein  86.39 
 
 
147 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297917  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  44.7 
 
 
412 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  42.42 
 
 
534 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  42.15 
 
 
534 aa  266  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  42.15 
 
 
534 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  42.15 
 
 
537 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  37.95 
 
 
489 aa  264  3e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  40.58 
 
 
537 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  41.16 
 
 
322 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  41.6 
 
 
534 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  37.4 
 
 
500 aa  252  8.000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  40.94 
 
 
299 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  33.76 
 
 
544 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1154  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  83.65 
 
 
104 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  33.99 
 
 
613 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  33.43 
 
 
665 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  30 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.22 
 
 
542 aa  146  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.22 
 
 
542 aa  146  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.72 
 
 
542 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  32.51 
 
 
475 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.78 
 
 
462 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  30.97 
 
 
509 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  35.43 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  37.5 
 
 
552 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.28 
 
 
522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.51 
 
 
415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.27 
 
 
515 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  37.17 
 
 
500 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  26.65 
 
 
534 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.33 
 
 
485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  30.09 
 
 
421 aa  128  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2833  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  40.38 
 
 
154 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
554 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.65 
 
 
521 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 
474 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  29.86 
 
 
546 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  36.97 
 
 
502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  31.18 
 
 
484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  31.18 
 
 
484 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  30.25 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  29.64 
 
 
526 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  26.82 
 
 
558 aa  106  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  32.51 
 
 
553 aa  106  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  29.87 
 
 
522 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  29.87 
 
 
522 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  25.08 
 
 
500 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25.38 
 
 
500 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  27.74 
 
 
523 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  31.63 
 
 
460 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  27.06 
 
 
550 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  24.38 
 
 
534 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  29.34 
 
 
743 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.06 
 
 
555 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.79 
 
 
561 aa  103  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  29.87 
 
 
523 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  28.36 
 
 
520 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  28.05 
 
 
519 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 
494 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.61 
 
 
558 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  28.95 
 
 
519 aa  100  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  28.8 
 
 
521 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.74 
 
 
482 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.8 
 
 
547 aa  100  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  29.33 
 
 
518 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  29.93 
 
 
522 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.23 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>