More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0896 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  100 
 
 		 527 aa  1090    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  72.68 
 
 		 528 aa  813    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  72.68 
 
 		 528 aa  813    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  44.58 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  51.86 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  41.8 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  51.86 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  41.41 
 
 		 525 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  45.17 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  44.74 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  41.06 
 
 		 525 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  48.12 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  44.62 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  39.57 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  50.13 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  48.08 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  39.64 
 
 		 525 aa  350  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  44.72 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  49.32 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  46.41 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  48.73 
 
 		 568 aa  342  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  45.86 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  46.7 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  45.58 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  49.24 
 
 		 343 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  47.14 
 
 		 506 aa  324  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  45.89 
 
 		 474 aa  318  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  45.89 
 
 		 550 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  38.37 
 
 		 534 aa  313  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  46.76 
 
 		 532 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  37.78 
 
 		 534 aa  312  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  38.45 
 
 		 534 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  38.43 
 
 		 537 aa  310  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  38.28 
 
 		 534 aa  309  6.999999999999999e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  47.06 
 
 		 549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  39.11 
 
 		 534 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  38.08 
 
 		 534 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  38.28 
 
 		 537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  46.48 
 
 		 545 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  39.89 
 
 		 489 aa  276  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  39.89 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  38.35 
 
 		 412 aa  243  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 		 299 aa  240  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  32.02 
 
 		 544 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  40.47 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  30.63 
 
 		 665 aa  209  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  30.21 
 
 		 546 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  30.75 
 
 		 613 aa  196  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.43 
 
 		 542 aa  176  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 		 542 aa  176  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 		 542 aa  176  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  32.2 
 
 		 462 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  30.08 
 
 		 515 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.75 
 
 		 509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  29.1 
 
 		 534 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.04 
 
 		 515 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.79 
 
 		 522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  30.41 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  30.81 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 		 415 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.13 
 
 		 546 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  28.64 
 
 		 552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  27.61 
 
 		 554 aa  143  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.37 
 
 		 484 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.16 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  29.23 
 
 		 547 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  28.88 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.49 
 
 		 485 aa  130  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.77 
 
 		 494 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.08 
 
 		 546 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  28.99 
 
 		 474 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 521 aa  124  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  28.12 
 
 		 550 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 		 555 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.06 
 
 		 553 aa  120  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.99 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  26.2 
 
 		 531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.61 
 
 		 506 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  26.04 
 
 		 606 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  28.08 
 
 		 442 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  26.04 
 
 		 606 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.3 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.54 
 
 		 522 aa  114  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  27.18 
 
 		 505 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  28.05 
 
 		 504 aa  113  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  34.15 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.95 
 
 		 488 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.39 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.22 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  26.84 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.13 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  27.8 
 
 		 465 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.27 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.74 
 
 		 590 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  25.24 
 
 		 522 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 449 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 449 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  27.51 
 
 		 518 aa  106  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.36 
 
 		 534 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>