More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2857 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  95.51 
 
 
445 aa  897    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  96.4 
 
 
445 aa  899    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
445 aa  931    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  60 
 
 
447 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  59.45 
 
 
441 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  59.22 
 
 
441 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  55 
 
 
443 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  56.26 
 
 
441 aa  505  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  51.93 
 
 
441 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  53.13 
 
 
460 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  52.29 
 
 
445 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  50.57 
 
 
449 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  52.27 
 
 
528 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  52 
 
 
528 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  47.39 
 
 
459 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  52.29 
 
 
527 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  48.1 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  48.1 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  47.93 
 
 
474 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  49.08 
 
 
525 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  54.52 
 
 
568 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  49.18 
 
 
525 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  48.01 
 
 
511 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  54.97 
 
 
343 aa  362  9e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1125  recombinase  54.09 
 
 
322 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0324535  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  49.72 
 
 
522 aa  353  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  50.86 
 
 
532 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  45.36 
 
 
525 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  44.89 
 
 
549 aa  338  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  50.28 
 
 
550 aa  336  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  49.29 
 
 
506 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  42.82 
 
 
534 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  42.58 
 
 
537 aa  329  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  43.07 
 
 
537 aa  329  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  42.82 
 
 
534 aa  328  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  42.82 
 
 
534 aa  329  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  42.34 
 
 
534 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  49.54 
 
 
545 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  42.34 
 
 
534 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  42.34 
 
 
534 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  43.02 
 
 
489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  42.03 
 
 
500 aa  299  8e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  45.61 
 
 
299 aa  263  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  39.72 
 
 
412 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  35.31 
 
 
544 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  32.29 
 
 
665 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  33.97 
 
 
546 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  32.99 
 
 
613 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  31.9 
 
 
542 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  31.9 
 
 
542 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  31.9 
 
 
542 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.99 
 
 
515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  29.98 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  28.95 
 
 
509 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 
554 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  30.26 
 
 
522 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  30.36 
 
 
415 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 
521 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  32 
 
 
462 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  30.15 
 
 
546 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  29.36 
 
 
475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  31.95 
 
 
515 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  32.59 
 
 
484 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  32.31 
 
 
484 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  29.84 
 
 
485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  29.46 
 
 
500 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.3 
 
 
534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  28.05 
 
 
502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  27.82 
 
 
421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.5 
 
 
540 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  29.85 
 
 
561 aa  123  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  27.86 
 
 
534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  29.26 
 
 
546 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.92 
 
 
519 aa  120  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  27.73 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.05 
 
 
547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.71 
 
 
558 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  26.71 
 
 
531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  28.5 
 
 
743 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  28.9 
 
 
474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.01 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.42 
 
 
479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  26.24 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.71 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.7 
 
 
551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  26.24 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  26.67 
 
 
449 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 
590 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  28.27 
 
 
550 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  28.27 
 
 
555 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  27.93 
 
 
547 aa  113  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.74 
 
 
555 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.64 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  27.68 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.81 
 
 
522 aa  109  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  26.72 
 
 
518 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.2 
 
 
579 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.32 
 
 
506 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.54 
 
 
537 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>