More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0336 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  100 
 
 
500 aa  1026    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  91.4 
 
 
500 aa  956    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  31.34 
 
 
462 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  29.94 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.96 
 
 
515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.75 
 
 
522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.17 
 
 
521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  29.93 
 
 
487 aa  127  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  24.14 
 
 
489 aa  125  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  32.53 
 
 
484 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  32.53 
 
 
484 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.23 
 
 
546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.63 
 
 
535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.75 
 
 
475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.22 
 
 
500 aa  121  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  27.42 
 
 
544 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25 
 
 
558 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.37 
 
 
511 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.08 
 
 
415 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.23 
 
 
542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  29.44 
 
 
272 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 
542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 
542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  21.91 
 
 
525 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.71 
 
 
586 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  24.19 
 
 
474 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.45 
 
 
519 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  24.55 
 
 
485 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.55 
 
 
498 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  25.76 
 
 
460 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.61 
 
 
488 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  25.38 
 
 
459 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.41 
 
 
479 aa  105  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.2 
 
 
528 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  25.42 
 
 
520 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  23.38 
 
 
528 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.64 
 
 
445 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.09 
 
 
525 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.39 
 
 
509 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  28.26 
 
 
445 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  27.44 
 
 
462 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.98 
 
 
539 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.43 
 
 
546 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.56 
 
 
523 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 
445 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  24.85 
 
 
523 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.11 
 
 
523 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  24.85 
 
 
523 aa  100  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  26.18 
 
 
462 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  30.04 
 
 
568 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.91 
 
 
421 aa  99  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  27.04 
 
 
449 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.65 
 
 
515 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  26.1 
 
 
521 aa  98.2  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.61 
 
 
447 aa  97.1  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  21.95 
 
 
527 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  24.63 
 
 
343 aa  96.7  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.38 
 
 
522 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  26.36 
 
 
460 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  26.02 
 
 
606 aa  94.7  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  26.02 
 
 
606 aa  94.7  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  26.52 
 
 
534 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.95 
 
 
441 aa  93.6  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  23.01 
 
 
613 aa  93.6  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  29.82 
 
 
549 aa  93.2  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.99 
 
 
458 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.05 
 
 
506 aa  93.2  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.73 
 
 
537 aa  93.2  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  29.74 
 
 
535 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  24.38 
 
 
445 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  30.28 
 
 
550 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.37 
 
 
441 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.24 
 
 
443 aa  90.5  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.88 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 
519 aa  90.1  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.18 
 
 
518 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.07 
 
 
534 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  27.64 
 
 
441 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.5 
 
 
522 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  26.04 
 
 
441 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.07 
 
 
537 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.9 
 
 
563 aa  88.6  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  21.15 
 
 
506 aa  88.6  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  29.95 
 
 
506 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.33 
 
 
547 aa  87.8  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.18 
 
 
522 aa  87  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.42 
 
 
534 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  23 
 
 
525 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  30 
 
 
295 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.72 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.37 
 
 
534 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  26.15 
 
 
532 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.67 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  20.62 
 
 
516 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  23.97 
 
 
569 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.48 
 
 
534 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  20.62 
 
 
516 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  26.35 
 
 
546 aa  84  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.29 
 
 
537 aa  83.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.16 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>