More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1983 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 546 aa  1115    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  48.88 
 
 		 665 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  51.6 
 
 		 613 aa  490  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  40.16 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  33.97 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 445 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.14 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.14 
 
 		 542 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  33.6 
 
 		 528 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  33.6 
 
 		 528 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.14 
 
 		 542 aa  203  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  32.78 
 
 		 527 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  31.69 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  33.07 
 
 		 525 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  32.6 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  35.26 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  33.25 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  29.09 
 
 		 525 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  31.67 
 
 		 447 aa  186  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.54 
 
 		 515 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  35.05 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 521 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  32.69 
 
 		 443 aa  177  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.87 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  39.19 
 
 		 522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  29.79 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.78 
 
 		 534 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  33.42 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  33.42 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  31.76 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  33.42 
 
 		 534 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  31.33 
 
 		 549 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  33.15 
 
 		 537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  32.88 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  33.15 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  32.59 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.99 
 
 		 515 aa  166  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  27.58 
 
 		 441 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  32.61 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  33.85 
 
 		 532 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.9 
 
 		 517 aa  163  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.15 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  32.95 
 
 		 568 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.59 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  27.13 
 
 		 441 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  28.12 
 
 		 555 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  32.81 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  28.62 
 
 		 489 aa  156  7e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.36 
 
 		 500 aa  156  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  31.35 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.46 
 
 		 415 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  30.52 
 
 		 462 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  31.63 
 
 		 343 aa  153  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.57 
 
 		 548 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  30.17 
 
 		 561 aa  150  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  30 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  32.3 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.14 
 
 		 510 aa  148  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  33.54 
 
 		 550 aa  148  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  33.99 
 
 		 484 aa  147  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  33.99 
 
 		 484 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  29.92 
 
 		 445 aa  146  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  30.64 
 
 		 544 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  29.22 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  28.16 
 
 		 561 aa  144  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.28 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  31.69 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.95 
 
 		 534 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.95 
 
 		 547 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.44 
 
 		 554 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.57 
 
 		 546 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 542 aa  140  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.77 
 
 		 558 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  29.33 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  27.72 
 
 		 460 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.03 
 
 		 547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.75 
 
 		 563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.92 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  24.17 
 
 		 552 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  29.15 
 
 		 551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  26.61 
 
 		 518 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  30.07 
 
 		 299 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.53 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  29.14 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  30.32 
 
 		 272 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  27.74 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  32.56 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  26.87 
 
 		 558 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.32 
 
 		 553 aa  121  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  29.73 
 
 		 537 aa  120  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  27.22 
 
 		 500 aa  120  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 281 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  27.49 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.95 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  27.49 
 
 		 550 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  27.33 
 
 		 641 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>