More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4166 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  100 
 
 		 460 aa  929    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  38.71 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  37.39 
 
 		 467 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  37.32 
 
 		 469 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  37.32 
 
 		 469 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  37.32 
 
 		 469 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  36.85 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  34.97 
 
 		 488 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  38 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  37.76 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  35.5 
 
 		 479 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  35.5 
 
 		 479 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  35.95 
 
 		 460 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  31.62 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  35.73 
 
 		 460 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  35.9 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  31.68 
 
 		 484 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.64 
 
 		 539 aa  170  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.83 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.83 
 
 		 458 aa  156  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.65 
 
 		 569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  29.52 
 
 		 503 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  29.85 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  27.44 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  31.14 
 
 		 497 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.19 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  28.74 
 
 		 522 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.72 
 
 		 529 aa  111  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.76 
 
 		 504 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  26.84 
 
 		 501 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  26.32 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  24.36 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25.76 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.53 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  21.52 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.25 
 
 		 485 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  24.77 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  28.66 
 
 		 484 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  28.66 
 
 		 484 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.8 
 
 		 475 aa  96.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 494 aa  96.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.64 
 
 		 546 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  27.59 
 
 		 506 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  21.57 
 
 		 542 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.48 
 
 		 511 aa  90.5  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.53 
 
 		 272 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21.29 
 
 		 542 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  26.96 
 
 		 531 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21.29 
 
 		 542 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.75 
 
 		 544 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.37 
 
 		 445 aa  86.7  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  21.04 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  26.94 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  29.68 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  21.39 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  26.67 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.38 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  21.08 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  25.39 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.13 
 
 		 521 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.57 
 
 		 525 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.75 
 
 		 527 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  27.97 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.78 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.35 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  27.57 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.24 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25.57 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.54 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.29 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  23.33 
 
 		 613 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.24 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.9 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  29.12 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  21.76 
 
 		 586 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  27.48 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.29 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.27 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.95 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.1 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  22.28 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.35 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  22.27 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  26.2 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.76 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  24.41 
 
 		 689 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  27.38 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.56 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  24.41 
 
 		 689 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.44 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.27 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  21.8 
 
 		 550 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.05 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  21.8 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.22 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  23.95 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  21.51 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  25.26 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>