More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0615 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  100 
 
 
461 aa  923    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  65.43 
 
 
467 aa  587  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  47.08 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  47.08 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  40.59 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  38.83 
 
 
460 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  34.26 
 
 
488 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  36.44 
 
 
465 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  33.12 
 
 
467 aa  219  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  32.5 
 
 
469 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  32.5 
 
 
469 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  32.5 
 
 
469 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  35.81 
 
 
460 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  35.81 
 
 
460 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  29.77 
 
 
460 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  33.16 
 
 
385 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  36.12 
 
 
484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  34.73 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  30.8 
 
 
497 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  32.06 
 
 
500 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  30.56 
 
 
503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  29.25 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  28.19 
 
 
522 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  30.89 
 
 
432 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  28.54 
 
 
506 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.67 
 
 
529 aa  133  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.99 
 
 
539 aa  133  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.57 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  27.71 
 
 
412 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  27.49 
 
 
494 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.36 
 
 
569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.94 
 
 
458 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.36 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.47 
 
 
475 aa  106  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  27.4 
 
 
511 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.87 
 
 
485 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  29.1 
 
 
335 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.47 
 
 
515 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.34 
 
 
462 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.8 
 
 
506 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.65 
 
 
546 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.91 
 
 
552 aa  96.3  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  35.5 
 
 
452 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.61 
 
 
586 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4146  Recombinase  30.51 
 
 
457 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407054  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.22 
 
 
485 aa  93.6  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  27.63 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  20.67 
 
 
524 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  27.51 
 
 
449 aa  91.3  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  25.91 
 
 
447 aa  90.9  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  22.87 
 
 
421 aa  90.9  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23.87 
 
 
535 aa  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.45 
 
 
525 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.17 
 
 
534 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 
445 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.61 
 
 
445 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.67 
 
 
525 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.43 
 
 
662 aa  86.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.57 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.01 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.25 
 
 
521 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.74 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.01 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  27.15 
 
 
531 aa  85.9  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.05 
 
 
504 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  20.54 
 
 
494 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  24.71 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.37 
 
 
537 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  23.52 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21.89 
 
 
542 aa  84.7  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21.89 
 
 
542 aa  84.7  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.66 
 
 
534 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  23.58 
 
 
500 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.97 
 
 
482 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  25 
 
 
532 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.34 
 
 
561 aa  83.6  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.01 
 
 
569 aa  83.2  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  22.68 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  21.62 
 
 
542 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.3 
 
 
534 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.21 
 
 
517 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.24 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  28.92 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.2 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  25.17 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 
549 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.47 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.24 
 
 
537 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  24.08 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.32 
 
 
584 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.08 
 
 
534 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  24.42 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  26.44 
 
 
578 aa  80.5  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.93 
 
 
484 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  28.93 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25.28 
 
 
441 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.18 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.04 
 
 
578 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>