More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3591 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  99.57 
 
 
460 aa  922    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  100 
 
 
460 aa  927    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  44.87 
 
 
460 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  38.88 
 
 
488 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  40.65 
 
 
467 aa  276  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  39.04 
 
 
469 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  39.04 
 
 
469 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  39.04 
 
 
469 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  37.34 
 
 
465 aa  252  8.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  38.91 
 
 
494 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  32.31 
 
 
460 aa  243  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  35.73 
 
 
460 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  35.18 
 
 
467 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  38.32 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  38.32 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  35.26 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  32.99 
 
 
484 aa  190  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  31.05 
 
 
503 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  38.75 
 
 
497 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  32.23 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  31.3 
 
 
522 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.36 
 
 
458 aa  142  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  29.48 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.48 
 
 
539 aa  139  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.17 
 
 
458 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.6 
 
 
511 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  28.6 
 
 
432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  28.92 
 
 
412 aa  126  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  27.84 
 
 
501 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.19 
 
 
529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  28.44 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 
494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  28.9 
 
 
506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.69 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  24.71 
 
 
474 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.93 
 
 
272 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  30.5 
 
 
534 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  29.94 
 
 
534 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  29.64 
 
 
534 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  29.64 
 
 
537 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  28.15 
 
 
335 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  29.64 
 
 
534 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  32.23 
 
 
546 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  30.24 
 
 
537 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.06 
 
 
475 aa  99.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  30.87 
 
 
534 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.34 
 
 
534 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28 
 
 
665 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4146  Recombinase  32.96 
 
 
457 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407054  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  21.69 
 
 
558 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  22.25 
 
 
500 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  29.35 
 
 
613 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  30.17 
 
 
452 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 
445 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  28.9 
 
 
527 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.52 
 
 
569 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 
445 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  23.08 
 
 
489 aa  91.3  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  29.66 
 
 
532 aa  90.1  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  21.56 
 
 
506 aa  90.1  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.08 
 
 
500 aa  89.7  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  31.05 
 
 
568 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  28.66 
 
 
528 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2571  recombinase  27.18 
 
 
417 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  28.66 
 
 
528 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  22.67 
 
 
555 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  22.67 
 
 
550 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  21.84 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  29.81 
 
 
509 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  31.6 
 
 
549 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.67 
 
 
447 aa  86.7  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  21.94 
 
 
521 aa  86.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3240  Recombinase  28.13 
 
 
582 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143535  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  31.25 
 
 
522 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.18 
 
 
484 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  29.37 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.94 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.21 
 
 
485 aa  84  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.24 
 
 
445 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  26.4 
 
 
544 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  26.6 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.58 
 
 
517 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.01 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  29.79 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  29.48 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  22.08 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  27.35 
 
 
550 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  28.63 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  30.1 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  26.32 
 
 
539 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  27.44 
 
 
490 aa  79.7  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  20 
 
 
546 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.14 
 
 
542 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.97 
 
 
555 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.14 
 
 
542 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0567  Resolvase domain protein  35 
 
 
577 aa  77.4  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  34.19 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  20.84 
 
 
554 aa  77.4  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  28.72 
 
 
462 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>