60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3240 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3240  Recombinase  100 
 
 		 582 aa  1173    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.143535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  27.82 
 
 		 494 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  29.88 
 
 		 460 aa  107  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  28.99 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  24.31 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  24.31 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  24.31 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  28.35 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  28.13 
 
 		 460 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  25.41 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.73 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  31.03 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  24.16 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  30.7 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  24.56 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.94 
 
 		 488 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  39.29 
 
 		 541 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  27.78 
 
 		 465 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 		 540 aa  53.9  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  28.7 
 
 		 542 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  27.04 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  28.44 
 
 		 539 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  25.68 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  24.65 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  28.44 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.03 
 
 		 521 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.77 
 
 		 517 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3757  Resolvase domain protein  34.45 
 
 		 341 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  22.84 
 
 		 461 aa  50.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  23.9 
 
 		 578 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  26.34 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  33.33 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  27.31 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  26.25 
 
 		 540 aa  48.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.88 
 
 		 537 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  22.78 
 
 		 488 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  28.81 
 
 		 601 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  38.64 
 
 		 336 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.14 
 
 		 597 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  28.81 
 
 		 578 aa  47.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.45 
 
 		 564 aa  47  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  31.46 
 
 		 251 aa  47  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  25.82 
 
 		 460 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.85 
 
 		 569 aa  46.2  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  25 
 
 		 506 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  21.67 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  23.41 
 
 		 522 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.9 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  33.06 
 
 		 295 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  24.37 
 
 		 576 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  26.32 
 
 		 460 aa  44.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  31.46 
 
 		 562 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.78 
 
 		 274 aa  44.3  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.92 
 
 		 662 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.39 
 
 		 519 aa  44.3  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  22.77 
 
 		 551 aa  44.3  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  22.51 
 
 		 523 aa  43.9  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  27 
 
 		 552 aa  43.9  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  24.19 
 
 		 554 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  22.08 
 
 		 523 aa  43.5  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>