More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1448 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  100 
 
 
467 aa  954    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  53.12 
 
 
469 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  53.12 
 
 
469 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  53.12 
 
 
469 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  37.8 
 
 
488 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  36.32 
 
 
460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  38.27 
 
 
460 aa  276  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  40.65 
 
 
460 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  36.71 
 
 
465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  40.65 
 
 
460 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  37.39 
 
 
460 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  36.31 
 
 
494 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  34.39 
 
 
479 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  34.39 
 
 
479 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  32.7 
 
 
461 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32.7 
 
 
458 aa  190  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.63 
 
 
458 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  29.32 
 
 
467 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  36.32 
 
 
484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.49 
 
 
539 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.38 
 
 
511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  29.28 
 
 
503 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.37 
 
 
569 aa  146  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  30.17 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  29.2 
 
 
500 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.39 
 
 
529 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  28.5 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.36 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  24.8 
 
 
501 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  29.49 
 
 
497 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  25.58 
 
 
412 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  26.34 
 
 
272 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 
521 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.52 
 
 
546 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.8 
 
 
542 aa  99.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.8 
 
 
542 aa  99.8  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.8 
 
 
542 aa  99  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  25.07 
 
 
526 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.59 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  26.38 
 
 
500 aa  96.7  7e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  24.89 
 
 
432 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  30.82 
 
 
509 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  23.43 
 
 
421 aa  94  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.65 
 
 
447 aa  93.6  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  29.79 
 
 
532 aa  93.6  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  34.67 
 
 
231 aa  93.2  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.48 
 
 
475 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  27.96 
 
 
511 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 
494 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  25.91 
 
 
543 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.31 
 
 
485 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  25.22 
 
 
444 aa  90.5  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  31.42 
 
 
299 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28.88 
 
 
534 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  23.43 
 
 
519 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  28.72 
 
 
412 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  28.08 
 
 
527 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  21.92 
 
 
534 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  27.75 
 
 
531 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.42 
 
 
544 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
534 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
534 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  25 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.74 
 
 
534 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
534 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.57 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.39 
 
 
519 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.69 
 
 
517 aa  83.2  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.88 
 
 
537 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25.97 
 
 
546 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.36 
 
 
613 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.17 
 
 
521 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  22.02 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  22.02 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.64 
 
 
558 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.43 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.52 
 
 
551 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  27.37 
 
 
545 aa  82  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
445 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  24.89 
 
 
552 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.98 
 
 
520 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.44 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  23.73 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.61 
 
 
484 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  26.32 
 
 
665 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  25.76 
 
 
568 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.61 
 
 
484 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  28.94 
 
 
441 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.99 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  24.66 
 
 
558 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  27.5 
 
 
549 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.16 
 
 
525 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 
474 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  27.21 
 
 
522 aa  77  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  25.07 
 
 
441 aa  77  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.28 
 
 
523 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.89 
 
 
523 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>