More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3608 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1085    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  98.75 
 
 		 546 aa  958    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3389  hypothetical protein  96.73 
 
 		 297 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  46.06 
 
 		 541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  44.1 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  42.02 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  42.08 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  42.15 
 
 		 542 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  39.13 
 
 		 578 aa  329  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  38.76 
 
 		 597 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  38.06 
 
 		 662 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  39.07 
 
 		 578 aa  323  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  39.07 
 
 		 601 aa  323  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  36.9 
 
 		 551 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  38.24 
 
 		 549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  37.3 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  38.2 
 
 		 552 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  37.48 
 
 		 584 aa  317  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 576 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  37.59 
 
 		 558 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  35.8 
 
 		 565 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  36.82 
 
 		 569 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  35.96 
 
 		 562 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  36.73 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  46.34 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  31.88 
 
 		 558 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  32.13 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  32.46 
 
 		 520 aa  203  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  49.25 
 
 		 277 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  33.94 
 
 		 532 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  47.32 
 
 		 251 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  29.42 
 
 		 738 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  31.5 
 
 		 626 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.57 
 
 		 521 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  29.15 
 
 		 707 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.64 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.99 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.52 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.79 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  27.05 
 
 		 546 aa  113  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  22.22 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.14 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.89 
 
 		 542 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.89 
 
 		 542 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.89 
 
 		 542 aa  106  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.54 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  22.78 
 
 		 552 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  24.75 
 
 		 511 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 		 510 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.55 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  22.79 
 
 		 488 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.22 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  26.68 
 
 		 707 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.33 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  30.63 
 
 		 279 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.91 
 
 		 498 aa  93.6  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.98 
 
 		 484 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.16 
 
 		 534 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.1 
 
 		 558 aa  93.2  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  29.19 
 
 		 534 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.78 
 
 		 482 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.87 
 
 		 516 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  26.65 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  24.47 
 
 		 516 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 415 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.31 
 
 		 547 aa  91.3  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.38 
 
 		 534 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.82 
 
 		 539 aa  90.5  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  28.61 
 
 		 534 aa  90.5  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.61 
 
 		 534 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  25.92 
 
 		 678 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.31 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.85 
 
 		 537 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.61 
 
 		 534 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.33 
 
 		 537 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  24.22 
 
 		 606 aa  87  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  24.22 
 
 		 606 aa  87  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  29.64 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  28.65 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 		 554 aa  83.6  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 		 542 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  27.07 
 
 		 460 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.21 
 
 		 534 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  26.72 
 
 		 862 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  25.96 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  23.38 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  21.12 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.97 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  21.71 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.06 
 
 		 553 aa  80.1  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  36.36 
 
 		 564 aa  80.1  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  28.77 
 
 		 524 aa  79.7  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  25.44 
 
 		 603 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.51 
 
 		 515 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  26.75 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.45 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  23.75 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.62 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  32.66 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>