More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20150 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  100 
 
 		 569 aa  1181    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.89 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  27.68 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  27.37 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  25.65 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  26.37 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  26.37 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  26.37 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.22 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.57 
 
 		 458 aa  109  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  25.83 
 
 		 488 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  22.97 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  34.52 
 
 		 479 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  34.52 
 
 		 479 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  26.49 
 
 		 494 aa  96.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.45 
 
 		 546 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  24.89 
 
 		 467 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.84 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.72 
 
 		 542 aa  91.3  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.72 
 
 		 542 aa  91.3  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  30.14 
 
 		 460 aa  90.5  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.52 
 
 		 542 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  25.21 
 
 		 460 aa  89.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  33.33 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  33.33 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.16 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  24.56 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.99 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.26 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  22.59 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  23.51 
 
 		 545 aa  78.2  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  23.29 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.7 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  21.36 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.41 
 
 		 498 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.19 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.58 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  23.62 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  23.71 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  23.39 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  23.21 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.83 
 
 		 515 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  22.02 
 
 		 534 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  31.86 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  22.88 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  22.88 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  22 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  35.71 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.27 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.93 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  22.88 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  22.88 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.05 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  23.58 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.42 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  22.94 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.68 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  32.05 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.82 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.28 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  23.68 
 
 		 449 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  24.46 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  26.79 
 
 		 532 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  23.34 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.59 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  30.63 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  26.92 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.27 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  20.54 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  20.54 
 
 		 550 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  23.29 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  22.16 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  23.4 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.17 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  23.92 
 
 		 523 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  20.4 
 
 		 528 aa  67  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  21.45 
 
 		 509 aa  67  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.86 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  23.1 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  27.27 
 
 		 550 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  20.15 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  33.12 
 
 		 201 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  33.12 
 
 		 201 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2529  recombinase  22.83 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  26.57 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29.52 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  22.37 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  26.73 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  23.08 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  22.55 
 
 		 525 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  30.05 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  23.26 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.18 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  26.94 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  23.04 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>