242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1974 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  100 
 
 		 503 aa  1002    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  34.69 
 
 		 460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  29.96 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  31.07 
 
 		 469 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  31.07 
 
 		 469 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  31.07 
 
 		 469 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  29.28 
 
 		 467 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  31.05 
 
 		 460 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  31.05 
 
 		 460 aa  136  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  31.35 
 
 		 467 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  29.52 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  28.88 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  30.68 
 
 		 465 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  29.09 
 
 		 494 aa  113  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  28.53 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  26.76 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  26.76 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  26.61 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  27.75 
 
 		 522 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  28.03 
 
 		 500 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  27.61 
 
 		 484 aa  97.8  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.82 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.62 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.83 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 523 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  23.74 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  27.64 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  27.54 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.27 
 
 		 569 aa  83.2  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 576 aa  83.2  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.53 
 
 		 518 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.37 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  22.59 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.67 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  22.6 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  23.88 
 
 		 543 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.71 
 
 		 519 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  24.52 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  26.94 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.71 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  26.38 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  22.94 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.14 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.36 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.52 
 
 		 551 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.71 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  21.9 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  21.9 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.94 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.71 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.64 
 
 		 528 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  27.61 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.32 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.57 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.36 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  27.1 
 
 		 532 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.02 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.76 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.34 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.37 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  27.09 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.65 
 
 		 552 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  27.25 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.8 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  27.43 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  21.03 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.93 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.86 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.88 
 
 		 584 aa  73.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.15 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.43 
 
 		 540 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.82 
 
 		 529 aa  73.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.96 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  24.87 
 
 		 578 aa  73.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.17 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.51 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  25.32 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.85 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.36 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.77 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  26.22 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  22.13 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.15 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.86 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.17 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  26.27 
 
 		 552 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.44 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  26.02 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  24.02 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.14 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.86 
 
 		 578 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  25.07 
 
 		 601 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.25 
 
 		 579 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.95 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  21.15 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.67 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20150  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.34 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.339427  normal  0.32342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>