More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1755 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3123  recombinase  56.32 
 
 		 552 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  66.54 
 
 		 578 aa  736    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  57.36 
 
 		 584 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  58.09 
 
 		 662 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 549 aa  1117    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  66.92 
 
 		 601 aa  723    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  58.36 
 
 		 569 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  58.23 
 
 		 551 aa  668    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  68.08 
 
 		 597 aa  738    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  63.43 
 
 		 578 aa  738    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  57.5 
 
 		 576 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  52.04 
 
 		 565 aa  558  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  53.29 
 
 		 564 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  50.18 
 
 		 562 aa  528  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  49.37 
 
 		 558 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  50.66 
 
 		 549 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  42.55 
 
 		 537 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  63.25 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  39.75 
 
 		 541 aa  365  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  78.6 
 
 		 277 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  37.68 
 
 		 540 aa  343  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  37.48 
 
 		 558 aa  326  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  37.3 
 
 		 539 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  38.7 
 
 		 546 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  64.32 
 
 		 251 aa  294  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  36.77 
 
 		 542 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  36.16 
 
 		 542 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  32.76 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  35.73 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  32.78 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.5 
 
 		 506 aa  167  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  30.25 
 
 		 626 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  31.28 
 
 		 564 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.17 
 
 		 485 aa  150  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  29 
 
 		 496 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.85 
 
 		 494 aa  137  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.11 
 
 		 546 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.87 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.05 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  25.33 
 
 		 738 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.87 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.02 
 
 		 517 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.23 
 
 		 510 aa  125  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.48 
 
 		 542 aa  124  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.18 
 
 		 542 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.18 
 
 		 542 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.34 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.05 
 
 		 479 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.82 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  29.61 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.77 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.77 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.93 
 
 		 563 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  33.04 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.28 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.33 
 
 		 522 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  25.06 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  25.06 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.11 
 
 		 511 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.91 
 
 		 548 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.48 
 
 		 542 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.48 
 
 		 554 aa  103  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  27.41 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  27.41 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.88 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  23.94 
 
 		 552 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  29.84 
 
 		 252 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1112  hypothetical protein  56.99 
 
 		 170 aa  100  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  27.46 
 
 		 553 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  28.57 
 
 		 707 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.54 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  27.14 
 
 		 537 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  26 
 
 		 515 aa  97.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3580  hypothetical protein  46.3 
 
 		 142 aa  97.8  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.06 
 
 		 509 aa  97.4  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  27.46 
 
 		 707 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  27.03 
 
 		 498 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.98 
 
 		 539 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  26.65 
 
 		 429 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.18 
 
 		 525 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.68 
 
 		 465 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.85 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.69 
 
 		 475 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  27.89 
 
 		 678 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.93 
 
 		 515 aa  93.2  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  27.16 
 
 		 516 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  27.38 
 
 		 516 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  23.27 
 
 		 561 aa  91.3  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  30.53 
 
 		 279 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  24.86 
 
 		 527 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  24.86 
 
 		 534 aa  90.9  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.16 
 
 		 488 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  24.86 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.42 
 
 		 565 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  23.93 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  24.91 
 
 		 862 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  27.87 
 
 		 552 aa  87  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  25.94 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24.55 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>