More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0396 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  100 
 
 		 558 aa  1142    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  49.37 
 
 		 551 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  49.74 
 
 		 576 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  50.54 
 
 		 552 aa  538  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  48.46 
 
 		 578 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 		 549 aa  529  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  48.35 
 
 		 662 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  50.57 
 
 		 601 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  48.07 
 
 		 578 aa  512  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  50 
 
 		 569 aa  511  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  50.38 
 
 		 597 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  48.51 
 
 		 565 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  48.94 
 
 		 564 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  44.1 
 
 		 584 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  47.69 
 
 		 562 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  47.65 
 
 		 549 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  42.65 
 
 		 537 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  41.05 
 
 		 541 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  37.74 
 
 		 542 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 540 aa  346  8e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  37.52 
 
 		 542 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  38.06 
 
 		 539 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  56.79 
 
 		 336 aa  322  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  36.98 
 
 		 558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  40.49 
 
 		 546 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  34.93 
 
 		 564 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  61.4 
 
 		 277 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  56.44 
 
 		 251 aa  251  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  35.09 
 
 		 520 aa  244  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  32.36 
 
 		 532 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  32.78 
 
 		 626 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.78 
 
 		 506 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  35.94 
 
 		 564 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.58 
 
 		 479 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  30.81 
 
 		 738 aa  143  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.78 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.76 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.64 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.88 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.88 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  28.04 
 
 		 547 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.12 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.27 
 
 		 546 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.12 
 
 		 522 aa  124  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.05 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.06 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.86 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.5 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  27.81 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  27.15 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  27.11 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.83 
 
 		 475 aa  114  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.53 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.96 
 
 		 561 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  23.49 
 
 		 534 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  24.4 
 
 		 707 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  26.35 
 
 		 515 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  31.44 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  30.85 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.96 
 
 		 429 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.35 
 
 		 517 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  27.67 
 
 		 707 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.11 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.54 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.53 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  29.73 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.57 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.51 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 		 522 aa  101  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.16 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25.41 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  26.38 
 
 		 526 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.46 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.21 
 
 		 504 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  26.54 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.9 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  23.51 
 
 		 535 aa  98.6  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  21.94 
 
 		 550 aa  98.6  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.38 
 
 		 553 aa  98.2  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  25.06 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  25.06 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.78 
 
 		 551 aa  97.8  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  25.9 
 
 		 515 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.95 
 
 		 522 aa  97.4  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  27.33 
 
 		 522 aa  97.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  23.57 
 
 		 518 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  26.27 
 
 		 552 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  23.59 
 
 		 522 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  25.32 
 
 		 523 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.58 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.43 
 
 		 465 aa  93.2  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24 
 
 		 509 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.04 
 
 		 579 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.52 
 
 		 527 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  23.04 
 
 		 551 aa  90.5  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  27.67 
 
 		 552 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  28.42 
 
 		 516 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  24.35 
 
 		 555 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  23.32 
 
 		 500 aa  90.5  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3389  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>