270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37130 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  100 
 
 
520 aa  1041    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  37.2 
 
 
562 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  35.7 
 
 
662 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  36.99 
 
 
551 aa  289  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  35.06 
 
 
584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  36.49 
 
 
597 aa  284  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  36.02 
 
 
569 aa  283  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  39.37 
 
 
552 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  35.4 
 
 
578 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  35.4 
 
 
601 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  34.8 
 
 
576 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  35.49 
 
 
565 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  35.73 
 
 
549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  36.33 
 
 
549 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  34.41 
 
 
578 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  35.19 
 
 
558 aa  250  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  36.76 
 
 
564 aa  246  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  35.38 
 
 
537 aa  246  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  41.69 
 
 
540 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  35.68 
 
 
541 aa  223  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  43 
 
 
336 aa  220  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  32.36 
 
 
532 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  33.63 
 
 
542 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  33.11 
 
 
542 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  32.46 
 
 
539 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  32.99 
 
 
546 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  33.47 
 
 
558 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  44.78 
 
 
251 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  31.1 
 
 
564 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  41.18 
 
 
277 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  29.72 
 
 
482 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.77 
 
 
542 aa  124  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.77 
 
 
542 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.77 
 
 
542 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.41 
 
 
506 aa  124  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.18 
 
 
494 aa  121  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.43 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  27.9 
 
 
626 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.73 
 
 
515 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.24 
 
 
546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.6 
 
 
521 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  39.87 
 
 
564 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  22.11 
 
 
496 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 
548 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.32 
 
 
415 aa  107  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  31.93 
 
 
414 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.39 
 
 
522 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.15 
 
 
484 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.2 
 
 
484 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 
565 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  27.42 
 
 
862 aa  100  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.49 
 
 
542 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.49 
 
 
554 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.77 
 
 
487 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.04 
 
 
510 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.19 
 
 
561 aa  93.6  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.17 
 
 
547 aa  93.2  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  20.92 
 
 
534 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  28.45 
 
 
738 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  24.09 
 
 
539 aa  90.5  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.19 
 
 
540 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.06 
 
 
537 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.07 
 
 
488 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  22.03 
 
 
552 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.43 
 
 
479 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  25.35 
 
 
518 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.36 
 
 
504 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  21.59 
 
 
500 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  25.66 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  25.84 
 
 
579 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.49 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.09 
 
 
555 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  21.84 
 
 
563 aa  83.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  22.8 
 
 
516 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.54 
 
 
551 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  23.41 
 
 
561 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  27.45 
 
 
476 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.08 
 
 
590 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  22.8 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.28 
 
 
462 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  23.67 
 
 
526 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  23.41 
 
 
537 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.17 
 
 
547 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.42 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  30.66 
 
 
211 aa  80.1  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  22.97 
 
 
554 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  21.93 
 
 
550 aa  79  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.43 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  33.64 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  29.47 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.91 
 
 
511 aa  77  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  23.71 
 
 
475 aa  77  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  28.96 
 
 
707 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  23.58 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  25.3 
 
 
467 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  22.84 
 
 
515 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  24.48 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  22.49 
 
 
505 aa  73.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.58 
 
 
546 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>