More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4193 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  59.52 
 
 		 561 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  100 
 
 		 555 aa  1136    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  56.51 
 
 		 561 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  55.92 
 
 		 547 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  52.87 
 
 		 565 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  51.75 
 
 		 590 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  52.45 
 
 		 518 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  51.02 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  49.54 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  47.66 
 
 		 579 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  41.48 
 
 		 537 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  61.22 
 
 		 377 aa  312  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0630  resolvase  61.13 
 
 		 247 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  31.62 
 
 		 548 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  28.37 
 
 		 554 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 		 542 aa  209  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  29.64 
 
 		 506 aa  200  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.5 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.46 
 
 		 494 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 		 546 aa  159  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.86 
 
 		 542 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  27.4 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.67 
 
 		 542 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.67 
 
 		 542 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 485 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.34 
 
 		 563 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.24 
 
 		 496 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.16 
 
 		 522 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.77 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  28.46 
 
 		 743 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.89 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  29.64 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.39 
 
 		 613 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  29.48 
 
 		 550 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.31 
 
 		 665 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  31.69 
 
 		 252 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  32.86 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.33 
 
 		 462 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  27.25 
 
 		 527 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.44 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  28.19 
 
 		 582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.74 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.75 
 
 		 521 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.84 
 
 		 509 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  26.4 
 
 		 525 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.96 
 
 		 445 aa  110  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.99 
 
 		 528 aa  110  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  27.58 
 
 		 544 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.86 
 
 		 528 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.15 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  23.94 
 
 		 539 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.48 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  25.45 
 
 		 534 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.22 
 
 		 534 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  25.71 
 
 		 534 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  27.08 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  25.71 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  25.45 
 
 		 534 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  25.45 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.06 
 
 		 525 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  27.21 
 
 		 558 aa  100  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  25 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.19 
 
 		 534 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.04 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.77 
 
 		 475 aa  98.6  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  26.49 
 
 		 607 aa  97.1  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.7 
 
 		 569 aa  96.3  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  22.39 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.45 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.66 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 		 441 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.01 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  25.19 
 
 		 460 aa  95.5  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  25.16 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.06 
 
 		 525 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  26.21 
 
 		 449 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  28.06 
 
 		 549 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.59 
 
 		 441 aa  94.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.66 
 
 		 484 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.65 
 
 		 465 aa  93.6  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  24.07 
 
 		 641 aa  93.6  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.38 
 
 		 562 aa  93.6  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.57 
 
 		 441 aa  93.6  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  25.82 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.3 
 
 		 578 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.55 
 
 		 519 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  24.12 
 
 		 565 aa  90.5  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  23.44 
 
 		 490 aa  90.5  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.96 
 
 		 552 aa  90.1  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  27.86 
 
 		 550 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  26.22 
 
 		 532 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  24.75 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  25.14 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.44 
 
 		 558 aa  88.2  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.66 
 
 		 662 aa  87.4  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  23.65 
 
 		 534 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.88 
 
 		 523 aa  87.4  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  26.1 
 
 		 513 aa  87.4  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>