More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1700 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  100 
 
 		 442 aa  910    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  78.18 
 
 		 430 aa  694    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  54.57 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  52.88 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  51.02 
 
 		 523 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  51.17 
 
 		 522 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  51.17 
 
 		 523 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  50.25 
 
 		 523 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  50.39 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  52.49 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  49.87 
 
 		 552 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  47.28 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  49.44 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  50.71 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  43.4 
 
 		 539 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  42.89 
 
 		 526 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  44.9 
 
 		 522 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  43.04 
 
 		 543 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  42.45 
 
 		 521 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  43.73 
 
 		 519 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  46.11 
 
 		 606 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  46.11 
 
 		 606 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  41.93 
 
 		 520 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  42.61 
 
 		 519 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  43.88 
 
 		 522 aa  299  7e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  40.38 
 
 		 534 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.12 
 
 		 553 aa  276  4e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  37.7 
 
 		 526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  41.03 
 
 		 547 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  49.12 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  34.9 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  35.71 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.87 
 
 		 558 aa  140  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  29.37 
 
 		 542 aa  136  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  29.37 
 
 		 542 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  29.37 
 
 		 542 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  30.26 
 
 		 479 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.11 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  30.25 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  31.71 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  29.16 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  32.59 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  28.08 
 
 		 527 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.02 
 
 		 515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  31.46 
 
 		 521 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  28.45 
 
 		 475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  29.38 
 
 		 544 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  29.47 
 
 		 535 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.65 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  26.1 
 
 		 537 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  29.73 
 
 		 558 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2698  hypothetical protein  39.58 
 
 		 194 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 485 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  29.22 
 
 		 484 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  27.41 
 
 		 528 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  27.41 
 
 		 528 aa  103  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  28.95 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  28.7 
 
 		 738 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  27.97 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.22 
 
 		 613 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 		 517 aa  99.8  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.14 
 
 		 546 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  27.88 
 
 		 586 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.23 
 
 		 546 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  27.44 
 
 		 475 aa  96.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  28.01 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.34 
 
 		 415 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.63 
 
 		 665 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  27.07 
 
 		 541 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0528  hypothetical protein  39.13 
 
 		 163 aa  95.1  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.99 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1525  Recombinase  28.7 
 
 		 299 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000398733  hitchhiker  0.000531049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2730  Recombinase  27.8 
 
 		 326 aa  93.6  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  27.74 
 
 		 421 aa  93.2  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.91 
 
 		 534 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  25.45 
 
 		 513 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 		 494 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.42 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  28.29 
 
 		 537 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  29.05 
 
 		 578 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.84 
 
 		 534 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.84 
 
 		 534 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  29.04 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.52 
 
 		 534 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  24.94 
 
 		 597 aa  91.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  28.17 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  27.84 
 
 		 537 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.52 
 
 		 534 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  29.61 
 
 		 509 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.44 
 
 		 510 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 568 aa  90.1  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  27.69 
 
 		 522 aa  90.1  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.18 
 
 		 537 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  28.83 
 
 		 489 aa  90.1  8e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  29.73 
 
 		 281 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  26.92 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  24.42 
 
 		 641 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  29.07 
 
 		 524 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.58 
 
 		 578 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  24.58 
 
 		 601 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>