More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0430 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  100 
 
 
535 aa  1095    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  44.87 
 
 
524 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  38.39 
 
 
586 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  29.95 
 
 
498 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  30 
 
 
606 aa  137  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  30 
 
 
606 aa  137  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  32.06 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  30.28 
 
 
479 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.02 
 
 
521 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  30.72 
 
 
519 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.91 
 
 
522 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.86 
 
 
519 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  30.06 
 
 
523 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.05 
 
 
546 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.81 
 
 
542 aa  130  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.81 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.81 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  30.82 
 
 
523 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.87 
 
 
487 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  26.28 
 
 
474 aa  126  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  30.38 
 
 
523 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  30.06 
 
 
523 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  29.84 
 
 
522 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  30.48 
 
 
522 aa  124  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  31.33 
 
 
534 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  31.73 
 
 
511 aa  124  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  29.75 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  27.74 
 
 
526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  22.63 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.86 
 
 
520 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  25.94 
 
 
522 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.86 
 
 
521 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.71 
 
 
415 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.93 
 
 
613 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  31.09 
 
 
506 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  23.03 
 
 
550 aa  119  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  22.63 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  28.66 
 
 
526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.01 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.71 
 
 
475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  30.19 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  25.7 
 
 
543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.89 
 
 
558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  26.01 
 
 
504 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.14 
 
 
539 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  28.75 
 
 
539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.26 
 
 
546 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  23.28 
 
 
551 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  23.47 
 
 
528 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  27.24 
 
 
431 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.43 
 
 
553 aa  110  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  29.62 
 
 
484 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  22.75 
 
 
528 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  29.43 
 
 
547 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  27.88 
 
 
515 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  21.8 
 
 
525 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  29.39 
 
 
535 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  29.3 
 
 
484 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  27.83 
 
 
552 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  29.47 
 
 
442 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.87 
 
 
506 aa  106  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.91 
 
 
505 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.13 
 
 
488 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.12 
 
 
665 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.59 
 
 
516 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  21.99 
 
 
525 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.59 
 
 
516 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.58 
 
 
494 aa  103  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.11 
 
 
541 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  23.82 
 
 
537 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  24.13 
 
 
537 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  25.8 
 
 
501 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  24.01 
 
 
515 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  22.37 
 
 
569 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.41 
 
 
421 aa  100  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 
542 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 
554 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.26 
 
 
541 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.73 
 
 
517 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.87 
 
 
511 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  23.68 
 
 
540 aa  97.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  24.8 
 
 
612 aa  97.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.87 
 
 
527 aa  96.7  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.05 
 
 
534 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  27.16 
 
 
554 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 
548 aa  93.6  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.08 
 
 
544 aa  93.6  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  22.14 
 
 
540 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  30.22 
 
 
430 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  23.62 
 
 
558 aa  93.2  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  21.91 
 
 
564 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.42 
 
 
475 aa  90.9  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  26.07 
 
 
626 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  22.25 
 
 
447 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  24.9 
 
 
549 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  23.92 
 
 
563 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.12 
 
 
445 aa  88.6  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  29.77 
 
 
342 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.57 
 
 
561 aa  87  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>