34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3389 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3389  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  96.73 
 
 		 539 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  77.22 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  33.63 
 
 		 540 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  31.25 
 
 		 541 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  32.61 
 
 		 542 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  32.17 
 
 		 542 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  30.74 
 
 		 537 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  30.04 
 
 		 584 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  31.84 
 
 		 578 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  30.53 
 
 		 662 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  32.07 
 
 		 549 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  28.76 
 
 		 597 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  28.57 
 
 		 551 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  29.07 
 
 		 601 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  29.07 
 
 		 578 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  30.43 
 
 		 552 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  28.92 
 
 		 558 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  29.33 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  30.77 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  26.13 
 
 		 549 aa  72.8  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.09 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.57 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  24.77 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  27.32 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  28.83 
 
 		 564 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 		 551 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  33.88 
 
 		 540 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.61 
 
 		 547 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 510 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  25.39 
 
 		 518 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  30.68 
 
 		 532 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.35 
 
 		 539 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.56 
 
 		 484 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>