More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1074 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  67.61 
 
 		 565 aa  774    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  100 
 
 		 562 aa  1149    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  59.04 
 
 		 549 aa  617  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  51.37 
 
 		 578 aa  568  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  53.8 
 
 		 601 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  51.15 
 
 		 552 aa  547  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  49.38 
 
 		 551 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  51.31 
 
 		 576 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  50.18 
 
 		 549 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  52.09 
 
 		 597 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  49.82 
 
 		 578 aa  528  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  51.45 
 
 		 569 aa  527  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  48.19 
 
 		 662 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  47.13 
 
 		 584 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  49.56 
 
 		 564 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  46.62 
 
 		 558 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  93.81 
 
 		 251 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  69.55 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  40.35 
 
 		 537 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  38.25 
 
 		 558 aa  329  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  36.68 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  37.78 
 
 		 542 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  37.22 
 
 		 542 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  34.79 
 
 		 540 aa  299  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  35.96 
 
 		 539 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  62.79 
 
 		 277 aa  292  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  37.35 
 
 		 546 aa  280  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  37.2 
 
 		 520 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  33.64 
 
 		 564 aa  267  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  31.63 
 
 		 532 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.92 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  32.14 
 
 		 626 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  46.32 
 
 		 564 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  29.09 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 		 494 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.29 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.1 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.12 
 
 		 487 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.48 
 
 		 479 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.25 
 
 		 496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  26.35 
 
 		 515 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.9 
 
 		 548 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  25.59 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  25.29 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.9 
 
 		 515 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  22.55 
 
 		 546 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.61 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.61 
 
 		 547 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 510 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.09 
 
 		 542 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.09 
 
 		 542 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.87 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.91 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  23.94 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.86 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  30 
 
 		 482 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  27.48 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.2 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.38 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.32 
 
 		 540 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.83 
 
 		 415 aa  98.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.3 
 
 		 515 aa  98.2  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 		 551 aa  97.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.46 
 
 		 563 aa  96.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  25.25 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  24.54 
 
 		 516 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.19 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  27.96 
 
 		 862 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  24.2 
 
 		 516 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.23 
 
 		 561 aa  95.1  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.14 
 
 		 521 aa  95.5  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.34 
 
 		 539 aa  94.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.2 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.38 
 
 		 555 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  24.3 
 
 		 707 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  25.25 
 
 		 553 aa  93.2  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  29.58 
 
 		 279 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.72 
 
 		 565 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  25.65 
 
 		 488 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  28.35 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  25.41 
 
 		 520 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  27.25 
 
 		 707 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  28.1 
 
 		 590 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1112  hypothetical protein  51.61 
 
 		 170 aa  90.1  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 524 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  26.11 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  30.24 
 
 		 518 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  30.24 
 
 		 518 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.48 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  24.34 
 
 		 518 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.52 
 
 		 521 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  27.2 
 
 		 521 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.09 
 
 		 522 aa  89.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.85 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  26.1 
 
 		 518 aa  87.8  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.4 
 
 		 511 aa  87.4  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.1 
 
 		 586 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  26.19 
 
 		 526 aa  87  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  27.63 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>