More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0568 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0568  recombinase  100 
 
 		 547 aa  1117    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  78.32 
 
 		 561 aa  886    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  55.92 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  53.16 
 
 		 561 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  52.97 
 
 		 590 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  52.18 
 
 		 565 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  52.34 
 
 		 540 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  52.34 
 
 		 551 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  47.24 
 
 		 579 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  48.82 
 
 		 518 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  42.72 
 
 		 537 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  55.51 
 
 		 377 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  31.57 
 
 		 548 aa  251  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.8 
 
 		 510 aa  230  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  31.16 
 
 		 517 aa  228  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.63 
 
 		 542 aa  225  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 554 aa  225  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0630  resolvase  47.37 
 
 		 247 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  30.43 
 
 		 563 aa  211  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.79 
 
 		 506 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  30.5 
 
 		 546 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  28.64 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  27.89 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.69 
 
 		 522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  29.1 
 
 		 415 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.98 
 
 		 542 aa  147  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.59 
 
 		 542 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.59 
 
 		 542 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.08 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.54 
 
 		 515 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.44 
 
 		 521 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  28.03 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.79 
 
 		 613 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  29.23 
 
 		 527 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.04 
 
 		 475 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.13 
 
 		 665 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  29.67 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  29.67 
 
 		 528 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  28.07 
 
 		 484 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  28.04 
 
 		 558 aa  128  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  28.26 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  28.26 
 
 		 550 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  29.77 
 
 		 534 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  29.41 
 
 		 443 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3120  recombinase  44.06 
 
 		 173 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.964732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.98 
 
 		 534 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.61 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  29.24 
 
 		 534 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.2 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  28.35 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  27.85 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.21 
 
 		 509 aa  124  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.72 
 
 		 534 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  28.98 
 
 		 537 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.98 
 
 		 537 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  28.46 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  27.92 
 
 		 447 aa  120  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  27.86 
 
 		 525 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.75 
 
 		 525 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  28.39 
 
 		 441 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  27.25 
 
 		 511 aa  118  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  28.05 
 
 		 445 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  27.61 
 
 		 641 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  28.72 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  32.87 
 
 		 211 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  28.89 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.54 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.53 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.81 
 
 		 498 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.15 
 
 		 429 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  27.13 
 
 		 582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  27.59 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.52 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.72 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  29.85 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 519 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  32.67 
 
 		 252 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  27.91 
 
 		 441 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25.28 
 
 		 549 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.74 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.84 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  26.96 
 
 		 462 aa  107  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.43 
 
 		 515 aa  106  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 504 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.58 
 
 		 576 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.91 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.48 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.51 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  22.42 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0096  hypothetical protein  29.86 
 
 		 261 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.61 
 
 		 562 aa  105  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  22.32 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25.64 
 
 		 558 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.85 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  26.59 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.27 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.35 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  28.36 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  25.62 
 
 		 743 aa  101  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  28.36 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>