241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3843 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  100 
 
 		 707 aa  1448    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  31.7 
 
 		 626 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  27.69 
 
 		 738 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  24.73 
 
 		 678 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  30.05 
 
 		 537 aa  152  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  28.78 
 
 		 540 aa  134  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.88 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  29.15 
 
 		 539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  29.3 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  24.78 
 
 		 707 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.76 
 
 		 565 aa  106  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  27.81 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.07 
 
 		 569 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  28.86 
 
 		 542 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  27.08 
 
 		 549 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.31 
 
 		 597 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  27.59 
 
 		 542 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.63 
 
 		 578 aa  99  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  26.49 
 
 		 578 aa  99  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  28.14 
 
 		 552 aa  98.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  26.49 
 
 		 601 aa  98.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  29.01 
 
 		 336 aa  97.4  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  27.46 
 
 		 549 aa  97.4  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  24.45 
 
 		 543 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  27.02 
 
 		 551 aa  94.7  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  27.11 
 
 		 479 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  27.15 
 
 		 584 aa  92.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.25 
 
 		 562 aa  91.3  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  26.77 
 
 		 576 aa  90.5  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.03 
 
 		 542 aa  90.5  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.8 
 
 		 542 aa  90.1  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.8 
 
 		 542 aa  90.1  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  31.49 
 
 		 564 aa  89.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.7 
 
 		 487 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.64 
 
 		 662 aa  89.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.69 
 
 		 498 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.06 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  26.93 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.55 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.74 
 
 		 521 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.58 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.46 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  23.99 
 
 		 552 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.29 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.29 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  26.02 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.54 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  31.98 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  27.07 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  27.07 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  27.07 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  32.28 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.36 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  26.9 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  24.26 
 
 		 580 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  33.33 
 
 		 279 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  22.05 
 
 		 515 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.12 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.07 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.77 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.71 
 
 		 494 aa  72  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 586 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  28.14 
 
 		 540 aa  72  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  25.53 
 
 		 494 aa  72  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.77 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.12 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  26.68 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  21.95 
 
 		 519 aa  70.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  28.96 
 
 		 520 aa  70.5  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  29.75 
 
 		 488 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  21.79 
 
 		 520 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.5 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3757  Resolvase domain protein  29.84 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  25 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  32.07 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.53 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.36 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  22.77 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  27.43 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  24.05 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  25.38 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  24.05 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  23.98 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  24.2 
 
 		 564 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.29 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  27.89 
 
 		 343 aa  66.6  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  24.22 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.47 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.52 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  29.7 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1691  resolvase domain-containing protein  23.83 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0333311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2045  resolvase family site-specific recombinase  28.19 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2201  resolvase family site-specific recombinase  28.19 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.62 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.3 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  26.73 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  22.22 
 
 		 511 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>