More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0819 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0819  recombinase  100 
 
 		 540 aa  1113    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  30.38 
 
 		 546 aa  146  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  28.51 
 
 		 513 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  26.95 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.68 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  25.27 
 
 		 641 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  27.59 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.74 
 
 		 515 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.09 
 
 		 509 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.61 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.73 
 
 		 569 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.76 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.48 
 
 		 484 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.71 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.35 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.24 
 
 		 542 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 542 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.24 
 
 		 542 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.25 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  28.25 
 
 		 576 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  25.62 
 
 		 551 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.68 
 
 		 540 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  25.59 
 
 		 511 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.36 
 
 		 504 aa  97.4  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.77 
 
 		 515 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  24.73 
 
 		 550 aa  96.7  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  31.98 
 
 		 283 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24 
 
 		 479 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.01 
 
 		 665 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.22 
 
 		 613 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  27.15 
 
 		 584 aa  94  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  21.98 
 
 		 504 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.77 
 
 		 662 aa  93.6  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  22.98 
 
 		 580 aa  93.6  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  30.37 
 
 		 626 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.28 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.59 
 
 		 521 aa  91.3  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 		 590 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.26 
 
 		 447 aa  91.3  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  25.96 
 
 		 522 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.69 
 
 		 522 aa  90.1  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.3 
 
 		 537 aa  90.1  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.73 
 
 		 551 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  32.5 
 
 		 295 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.38 
 
 		 561 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  24.71 
 
 		 597 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  24.35 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  31.02 
 
 		 281 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  23.81 
 
 		 485 aa  88.6  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  25.27 
 
 		 540 aa  88.6  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  24.75 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.27 
 
 		 578 aa  87  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  24.63 
 
 		 554 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  29.92 
 
 		 564 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.45 
 
 		 547 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  25.94 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  25.94 
 
 		 601 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  22.75 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  26.38 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  27.78 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.28 
 
 		 534 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  25.47 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  24.56 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  24.56 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  25.68 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  22.88 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  21.77 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  26.4 
 
 		 542 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  26.7 
 
 		 689 aa  84  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  25.95 
 
 		 685 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  22.1 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.9 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  25.66 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.58 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25.29 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  23.74 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  26.86 
 
 		 521 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  23.53 
 
 		 537 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.46 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  25.11 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  28.99 
 
 		 549 aa  80.1  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.79 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  27.21 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.64 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.74 
 
 		 524 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  26.4 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  23.26 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.66 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  31.33 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  22.66 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  26.13 
 
 		 644 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.11 
 
 		 517 aa  76.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  22.87 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  26.17 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.99 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  22.84 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  21.35 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  23.29 
 
 		 552 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>