More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0796 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  100 
 
 
421 aa  859    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  31.96 
 
 
475 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.96 
 
 
462 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  25.4 
 
 
525 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  29.06 
 
 
525 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  30.32 
 
 
528 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  30.32 
 
 
528 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  31.56 
 
 
527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  30.2 
 
 
544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  28.39 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  35.14 
 
 
613 aa  141  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.72 
 
 
542 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 
542 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 
542 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 
511 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  28.13 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  26.18 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.55 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.06 
 
 
665 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27.82 
 
 
445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.82 
 
 
445 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  30.69 
 
 
534 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.47 
 
 
534 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  31.68 
 
 
489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.53 
 
 
509 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  30.09 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  31.68 
 
 
500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.95 
 
 
521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  29.6 
 
 
441 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  27.53 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  29.09 
 
 
443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  30.69 
 
 
537 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  30.69 
 
 
534 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.06 
 
 
525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.2 
 
 
534 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.2 
 
 
534 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  30.36 
 
 
537 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  28.84 
 
 
462 aa  126  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.19 
 
 
515 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.89 
 
 
522 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  28.84 
 
 
462 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  27.42 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  32.56 
 
 
546 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  27.66 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  29.7 
 
 
534 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  25.99 
 
 
554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.92 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.12 
 
 
546 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  28.62 
 
 
449 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  25.43 
 
 
474 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.31 
 
 
510 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  28.96 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  31.9 
 
 
545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  32.5 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  31.6 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.28 
 
 
506 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  30.79 
 
 
441 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  25.78 
 
 
518 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  25.97 
 
 
546 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  26.97 
 
 
474 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 
523 aa  107  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.29 
 
 
548 aa  107  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.68 
 
 
523 aa  106  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  26.02 
 
 
460 aa  106  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.46 
 
 
484 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  25.71 
 
 
485 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.73 
 
 
458 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  26.79 
 
 
558 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  26.57 
 
 
412 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.01 
 
 
484 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  28.77 
 
 
522 aa  103  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  24.55 
 
 
517 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  25.9 
 
 
568 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  36.73 
 
 
272 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  27.44 
 
 
506 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  26.97 
 
 
500 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  26.37 
 
 
606 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  26.37 
 
 
606 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.78 
 
 
523 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  25.41 
 
 
535 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.81 
 
 
517 aa  100  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  23.35 
 
 
519 aa  99.8  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 
522 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25.91 
 
 
500 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  27.48 
 
 
524 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.46 
 
 
569 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  24.83 
 
 
522 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  24.7 
 
 
523 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.7 
 
 
458 aa  96.7  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24 
 
 
515 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.88 
 
 
551 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  25.22 
 
 
449 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  25.22 
 
 
449 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  28.68 
 
 
504 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 
542 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  25.07 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  27.13 
 
 
558 aa  94.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 
554 aa  94.4  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  23.43 
 
 
467 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  29.76 
 
 
299 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>