More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0974 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  100 
 
 
513 aa  1020    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  28.88 
 
 
505 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  30.05 
 
 
540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  29.65 
 
 
641 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  29.75 
 
 
515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  31.66 
 
 
484 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.86 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  33.74 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  31.66 
 
 
484 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  28.8 
 
 
580 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  32.35 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  27.27 
 
 
547 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  32.21 
 
 
546 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.65 
 
 
506 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.58 
 
 
515 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 
504 aa  109  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  31.23 
 
 
522 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  28.31 
 
 
558 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.97 
 
 
519 aa  109  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  30.03 
 
 
445 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  29.87 
 
 
445 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  31.1 
 
 
534 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  30.03 
 
 
415 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  25.48 
 
 
475 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  29.02 
 
 
445 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  36.44 
 
 
281 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  30.65 
 
 
534 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  35.6 
 
 
534 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 
542 aa  103  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 
542 aa  103  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  35.2 
 
 
537 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  32.19 
 
 
511 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.33 
 
 
542 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  34.8 
 
 
534 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  30.65 
 
 
443 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  35.2 
 
 
534 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.24 
 
 
526 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  34.8 
 
 
534 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  26.5 
 
 
511 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  29.15 
 
 
429 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  34 
 
 
537 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  25.06 
 
 
504 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  27.02 
 
 
561 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  29.1 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  35.04 
 
 
283 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  27.96 
 
 
521 aa  98.2  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  26.7 
 
 
552 aa  97.8  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  30.24 
 
 
549 aa  97.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  24.62 
 
 
603 aa  97.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  32.93 
 
 
545 aa  97.1  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.17 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.14 
 
 
546 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  28.17 
 
 
506 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  27.89 
 
 
525 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  27.24 
 
 
519 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  25.53 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  22.09 
 
 
537 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  25.57 
 
 
534 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  33.74 
 
 
568 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  27.91 
 
 
522 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.36 
 
 
520 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  27.76 
 
 
488 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.67 
 
 
553 aa  94.4  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  26.33 
 
 
430 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  25.38 
 
 
442 aa  94.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  26.5 
 
 
441 aa  94.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.36 
 
 
537 aa  93.6  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.75 
 
 
509 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 
522 aa  93.2  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  28.61 
 
 
517 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  28.12 
 
 
525 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  28.49 
 
 
525 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  35.05 
 
 
532 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.22 
 
 
494 aa  91.3  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  28.01 
 
 
527 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  30.1 
 
 
522 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  28.57 
 
 
441 aa  91.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.36 
 
 
522 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  25.38 
 
 
528 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  26.05 
 
 
665 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  26.81 
 
 
521 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  32.16 
 
 
462 aa  90.9  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  25.38 
 
 
528 aa  90.5  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  25.57 
 
 
501 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  30.04 
 
 
523 aa  90.1  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  32.16 
 
 
462 aa  90.1  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  30.6 
 
 
523 aa  90.1  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  26.77 
 
 
543 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  28.83 
 
 
558 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  28.23 
 
 
535 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  29.73 
 
 
738 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  31.62 
 
 
295 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  34.8 
 
 
412 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  28.11 
 
 
526 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  34.72 
 
 
550 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.83 
 
 
561 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  25.78 
 
 
555 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  30.79 
 
 
540 aa  87.4  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  31.91 
 
 
500 aa  86.7  9e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  31.3 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>