More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2122 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  100 
 
 		 547 aa  1114    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  36.88 
 
 		 534 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  41.03 
 
 		 442 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  32.28 
 
 		 606 aa  220  5e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  32.28 
 
 		 606 aa  220  5e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  31.66 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  32.76 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  32.15 
 
 		 526 aa  212  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  32.33 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  37.7 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  33.25 
 
 		 521 aa  210  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  33.96 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  30.36 
 
 		 552 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  32.16 
 
 		 519 aa  206  9e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  37.54 
 
 		 522 aa  205  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  35.14 
 
 		 535 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.05 
 
 		 553 aa  202  9e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  31.86 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  33.49 
 
 		 522 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  36.05 
 
 		 522 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  31.32 
 
 		 539 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  31.46 
 
 		 523 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  30.47 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  34.64 
 
 		 430 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  29.15 
 
 		 522 aa  194  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  35.5 
 
 		 431 aa  193  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  29.18 
 
 		 518 aa  188  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.99 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  29.81 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0420  resolvase domain-containing protein  40.26 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000164103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  29.4 
 
 		 526 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.9 
 
 		 613 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  23.95 
 
 		 546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.54 
 
 		 479 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.31 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.47 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.42 
 
 		 665 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.89 
 
 		 488 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.57 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.75 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  24.18 
 
 		 537 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.33 
 
 		 542 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.33 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.33 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0494  resolvase, N-terminal domain protein  29.64 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.177718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 513 aa  126  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  30.94 
 
 		 505 aa  124  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.24 
 
 		 498 aa  124  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.88 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.11 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  31.17 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.61 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  27.72 
 
 		 496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  23.68 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.99 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.29 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.7 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  26.94 
 
 		 541 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  25.78 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.34 
 
 		 445 aa  113  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  27.93 
 
 		 445 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.9 
 
 		 539 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.13 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  29.43 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  30.27 
 
 		 494 aa  106  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.32 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.06 
 
 		 484 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  26.23 
 
 		 443 aa  103  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.37 
 
 		 586 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0138  resolvase family site-specific recombinase  32.01 
 
 		 516 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.9 
 
 		 489 aa  101  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  29.12 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.17 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  23.74 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  25.98 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  27.33 
 
 		 543 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  27.33 
 
 		 543 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.84 
 
 		 524 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  22.22 
 
 		 509 aa  97.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  28.73 
 
 		 568 aa  97.1  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.94 
 
 		 548 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30.24 
 
 		 281 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  22.39 
 
 		 555 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.48 
 
 		 525 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.21 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  22.29 
 
 		 482 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  24.35 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  21.93 
 
 		 515 aa  94.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  26.71 
 
 		 532 aa  94  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.96 
 
 		 447 aa  93.6  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  22.29 
 
 		 465 aa  93.6  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  25.61 
 
 		 521 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  21.73 
 
 		 641 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  30.67 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  29.48 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  29.48 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  29.48 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.71 
 
 		 485 aa  90.9  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.74 
 
 		 458 aa  90.9  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 540 aa  90.5  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>