172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5403 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  100 
 
 		 279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  31.21 
 
 		 537 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  31.7 
 
 		 738 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  31.16 
 
 		 542 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  30.43 
 
 		 542 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  32.17 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  32.51 
 
 		 626 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  31.16 
 
 		 576 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  31.05 
 
 		 541 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  32.29 
 
 		 558 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  30.28 
 
 		 565 aa  102  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  32.04 
 
 		 564 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  28.07 
 
 		 540 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  31.34 
 
 		 569 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  29.41 
 
 		 549 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  28.98 
 
 		 578 aa  95.5  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  30.63 
 
 		 546 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  30.63 
 
 		 539 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  28.67 
 
 		 564 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  29.58 
 
 		 562 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  28.52 
 
 		 662 aa  92.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  28.52 
 
 		 551 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  28.87 
 
 		 597 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  30.53 
 
 		 549 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  28.52 
 
 		 584 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  28.46 
 
 		 552 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  29.37 
 
 		 578 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  29.37 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  31.33 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  28.67 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  33.33 
 
 		 707 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  23.96 
 
 		 558 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  21.3 
 
 		 580 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.96 
 
 		 542 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.5 
 
 		 542 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.5 
 
 		 542 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  30.41 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.37 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.63 
 
 		 505 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  28.91 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.09 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  20.63 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.43 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.76 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  24.71 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  25.82 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.73 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  29.17 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.48 
 
 		 521 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  22.6 
 
 		 550 aa  62.4  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.46 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  22.81 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.5 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.51 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  22.84 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  21.3 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.43 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  26.5 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.31 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1994  resolvase  26.92 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.854383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  24.27 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  25.23 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.79 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1941  putative site-specific recombinase, resolvase family  26.72 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.292978  normal  0.0530197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2033  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  20.58 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  25.11 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.11 
 
 		 516 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.11 
 
 		 516 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.92 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  24.81 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28.37 
 
 		 534 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  26.32 
 
 		 707 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0738  resolvase domain-containing protein  26.41 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0136169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  26.01 
 
 		 521 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.83 
 
 		 534 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.92 
 
 		 537 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  22.71 
 
 		 494 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  27.88 
 
 		 537 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  28.82 
 
 		 546 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  27.88 
 
 		 534 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.4 
 
 		 534 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.23 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  24.47 
 
 		 509 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.4 
 
 		 534 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  21.88 
 
 		 475 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  27.88 
 
 		 534 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  25.67 
 
 		 537 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3067  resolvase  26.36 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00040652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  30.72 
 
 		 522 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2045  resolvase family site-specific recombinase  25.21 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  26.19 
 
 		 678 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2201  resolvase family site-specific recombinase  25.21 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  23.61 
 
 		 526 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  26.35 
 
 		 521 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  25.87 
 
 		 523 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  23.44 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  26.64 
 
 		 862 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  29.87 
 
 		 441 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>