173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0028 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  88.29 
 
 		 521 aa  931    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  76 
 
 		 521 aa  791    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  72.39 
 
 		 521 aa  781    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  76 
 
 		 521 aa  791    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  100 
 
 		 537 aa  1107    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  77.78 
 
 		 521 aa  815    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  59.92 
 
 		 523 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  59.52 
 
 		 523 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  61.07 
 
 		 497 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  60.32 
 
 		 524 aa  615  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  56.6 
 
 		 518 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  56.6 
 
 		 518 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  56.69 
 
 		 528 aa  571  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  56.09 
 
 		 519 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  44.03 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  43.84 
 
 		 518 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  43.84 
 
 		 518 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  44.92 
 
 		 519 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  45.8 
 
 		 534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  45.91 
 
 		 534 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  41.85 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  44.74 
 
 		 568 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  79.05 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  58.75 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  40.95 
 
 		 559 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.53 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  27.83 
 
 		 537 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  25.98 
 
 		 547 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  55.17 
 
 		 157 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  28.9 
 
 		 554 aa  94.7  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.9 
 
 		 542 aa  94.4  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  29.31 
 
 		 563 aa  93.6  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.34 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.54 
 
 		 517 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.82 
 
 		 494 aa  91.3  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  28.16 
 
 		 496 aa  90.1  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  27.54 
 
 		 548 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  30.75 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.31 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  29.3 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  28.53 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.33 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  29.39 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  24.34 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.2 
 
 		 539 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.54 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.05 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  29.63 
 
 		 541 aa  74.7  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  29.35 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.54 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  25.68 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.6 
 
 		 524 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25 
 
 		 561 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.78 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  26.56 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  27.24 
 
 		 579 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  29.15 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.23 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  24.92 
 
 		 540 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  28.52 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.85 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.94 
 
 		 665 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.65 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.65 
 
 		 542 aa  67  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.65 
 
 		 542 aa  67  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.88 
 
 		 546 aa  67  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.52 
 
 		 540 aa  67  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  28.25 
 
 		 738 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.43 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  25.23 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 576 aa  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  28.81 
 
 		 578 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  29.07 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.25 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  27.24 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  25.96 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.88 
 
 		 521 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.54 
 
 		 590 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  25.46 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2733  recombinase  29.27 
 
 		 247 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  23.47 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  26.94 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.21 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  23.25 
 
 		 516 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.58 
 
 		 584 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 549 aa  62  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.02 
 
 		 551 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  25.66 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.96 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1686  recombinase  31.03 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0526693  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.3 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  27.41 
 
 		 540 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  22.96 
 
 		 555 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  29.1 
 
 		 251 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  28.52 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  23.7 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>