55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2733 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2733  recombinase  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2538  recombinase  61.84 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1686  recombinase  64.04 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0526693  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1341  recombinase  43.43 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  37.16 
 
 		 656 aa  85.1  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  30.25 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  29.01 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  28.65 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  28.65 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  28.65 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  29.27 
 
 		 537 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  26.92 
 
 		 516 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  26.92 
 
 		 516 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  26.06 
 
 		 518 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  26.06 
 
 		 518 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  26.83 
 
 		 521 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  27.97 
 
 		 487 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  26.09 
 
 		 519 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  29.25 
 
 		 475 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  28.05 
 
 		 521 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  29.41 
 
 		 498 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  29.38 
 
 		 598 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  26.55 
 
 		 518 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  27.81 
 
 		 488 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  29.76 
 
 		 534 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  27.81 
 
 		 534 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  26.67 
 
 		 568 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  25.44 
 
 		 517 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  23.81 
 
 		 537 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  27.88 
 
 		 521 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  27.88 
 
 		 521 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  27.88 
 
 		 521 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  21.84 
 
 		 504 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  29.45 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.9 
 
 		 613 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32 
 
 		 274 aa  45.4  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  29.63 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  30.25 
 
 		 488 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  26.35 
 
 		 519 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  27.33 
 
 		 510 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  30.23 
 
 		 738 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  29.92 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  26.24 
 
 		 612 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  28.44 
 
 		 541 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.14 
 
 		 484 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.18 
 
 		 479 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  28.03 
 
 		 552 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  32.84 
 
 		 535 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.44 
 
 		 665 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  29.94 
 
 		 497 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2325  recombinase  24.17 
 
 		 697 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 504 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  34.38 
 
 		 524 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3310  recombinase family  23.78 
 
 		 501 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.19852  hitchhiker  0.000000416205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  30.37 
 
 		 556 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>