172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3172 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  77.43 
 
 		 537 aa  824    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  100 
 
 		 521 aa  1073    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  78.17 
 
 		 521 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  61.07 
 
 		 524 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  78.38 
 
 		 521 aa  815    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  74.8 
 
 		 521 aa  801    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  78.38 
 
 		 521 aa  815    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  61.17 
 
 		 497 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  58.55 
 
 		 523 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  58.15 
 
 		 523 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  57.8 
 
 		 519 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  55.21 
 
 		 518 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  55.21 
 
 		 518 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  58.68 
 
 		 528 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  44.62 
 
 		 518 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  44.42 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  44.42 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  44.88 
 
 		 519 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  42.43 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  45.26 
 
 		 534 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  46.95 
 
 		 568 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  44.27 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  81.03 
 
 		 339 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  59.41 
 
 		 328 aa  352  8e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  40.83 
 
 		 559 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  29.43 
 
 		 494 aa  110  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  30.03 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  57.47 
 
 		 157 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.39 
 
 		 517 aa  100  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.94 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  28.66 
 
 		 563 aa  93.2  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 		 548 aa  90.5  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.73 
 
 		 496 aa  87.4  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 		 542 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 		 554 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.57 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  27.68 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.9 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.5 
 
 		 547 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  28.08 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  24.68 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  25.45 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.65 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  27.03 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  29.73 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.25 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.15 
 
 		 540 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  27.42 
 
 		 738 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.39 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.82 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  26.25 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  29.64 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.77 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.24 
 
 		 515 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  27.3 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  22.56 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.99 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  25.94 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  26.86 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.88 
 
 		 613 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  26.94 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.83 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  27.65 
 
 		 576 aa  66.6  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.94 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  25.83 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  25.83 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  31.36 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  25.56 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  28.69 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.27 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.21 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  26.96 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.19 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  27.92 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.42 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  22.49 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  25.71 
 
 		 552 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  28.81 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.21 
 
 		 498 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  27.82 
 
 		 601 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.42 
 
 		 555 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  26.61 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  27.82 
 
 		 578 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.52 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  27.17 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.24 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  26.33 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.33 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  24.54 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  29.03 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  27.65 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.37 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  24.26 
 
 		 590 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.19 
 
 		 540 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  27.04 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.84 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.76 
 
 		 584 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>