188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0526 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0526  recombinase  100 
 
 		 524 aa  1078    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  61.94 
 
 		 521 aa  634    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  74.25 
 
 		 497 aa  790    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  59.41 
 
 		 523 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  60.88 
 
 		 521 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  60.88 
 
 		 521 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  59.6 
 
 		 523 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  60 
 
 		 521 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  58.88 
 
 		 521 aa  621  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  60.32 
 
 		 537 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  60.59 
 
 		 519 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  56.41 
 
 		 518 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  56.41 
 
 		 518 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  58.91 
 
 		 528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  46.53 
 
 		 519 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  44.31 
 
 		 518 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  44.31 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  44.31 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  44.88 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  43.59 
 
 		 534 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  44.99 
 
 		 568 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  42.32 
 
 		 534 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  67.32 
 
 		 339 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  56.11 
 
 		 328 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  39.94 
 
 		 559 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  29.45 
 
 		 506 aa  113  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  52.53 
 
 		 157 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.13 
 
 		 517 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.21 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.64 
 
 		 510 aa  97.1  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  26.07 
 
 		 537 aa  91.3  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  28.41 
 
 		 541 aa  88.6  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.63 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 		 554 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.35 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 		 542 aa  84.7  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.19 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  30.4 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  27.27 
 
 		 578 aa  80.5  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.59 
 
 		 548 aa  80.1  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  28.77 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  27.65 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  29.39 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  28.77 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  27.86 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.81 
 
 		 547 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  26.01 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  27.48 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.8 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  26.3 
 
 		 597 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  27.19 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.8 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.81 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  30.24 
 
 		 576 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  29.75 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  28.25 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.01 
 
 		 613 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  27.85 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.66 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.19 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  28.49 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.07 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  25.93 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  25.93 
 
 		 601 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.07 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.91 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.07 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  27.92 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  22.93 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  25 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.41 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.86 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  25.47 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  27.53 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  25.57 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.36 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  24.31 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.44 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  26.54 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  26.83 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.67 
 
 		 552 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 		 281 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  26.9 
 
 		 534 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  27.72 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  27.24 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.92 
 
 		 662 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  27.21 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.43 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  22.5 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.67 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.57 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.57 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.81 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.84 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  26.11 
 
 		 738 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  26.51 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>