173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0830 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  100 
 
 		 534 aa  1108    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  90.45 
 
 		 534 aa  1016    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  46.59 
 
 		 521 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  46.59 
 
 		 521 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  44.75 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  44.75 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  45.91 
 
 		 537 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  43.87 
 
 		 523 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3812  recombinase  43.68 
 
 		 523 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  45.4 
 
 		 521 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  44.76 
 
 		 521 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  44.62 
 
 		 519 aa  425  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  44.58 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  42.32 
 
 		 524 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  43.78 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  44.07 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  41.95 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  41.75 
 
 		 518 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  41.75 
 
 		 518 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  41.26 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  41.13 
 
 		 518 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  36.77 
 
 		 568 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  49.34 
 
 		 328 aa  286  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  45.45 
 
 		 339 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  32.32 
 
 		 559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.89 
 
 		 547 aa  91.3  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25.86 
 
 		 537 aa  90.5  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.99 
 
 		 561 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  49.43 
 
 		 157 aa  84.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  30.48 
 
 		 578 aa  83.6  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.56 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  29.01 
 
 		 549 aa  81.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  28.48 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  29.37 
 
 		 548 aa  80.1  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.74 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  27.99 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  27.95 
 
 		 549 aa  77  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.38 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  27.81 
 
 		 569 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  28.25 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 		 540 aa  74.7  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  23.57 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  27.15 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  24.46 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  26.32 
 
 		 662 aa  73.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.3 
 
 		 597 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 		 590 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  26.77 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 584 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  24.76 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  26.25 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  24.35 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.76 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.62 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  25.92 
 
 		 535 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.27 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  25.97 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1501  hypothetical protein  26.14 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.420622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.56 
 
 		 561 aa  70.1  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  26.64 
 
 		 601 aa  70.1  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.69 
 
 		 542 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.7 
 
 		 510 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  26.64 
 
 		 578 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.27 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.31 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.4 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  27.24 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.56 
 
 		 498 aa  67  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  28.7 
 
 		 563 aa  67  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.97 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.4 
 
 		 546 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.5 
 
 		 521 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  27.99 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  27.42 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  25.29 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  28.01 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.74 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  26.48 
 
 		 579 aa  65.1  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  23.38 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  26.33 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.25 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.42 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  24.9 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.68 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1527  Resolvase domain protein  25.99 
 
 		 431 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144014  hitchhiker  0.00000000612209 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  25.77 
 
 		 518 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  23.91 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  26.32 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  26.85 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  29.91 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.44 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.78 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.2 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  26.95 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.1 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.19 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>