More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3078 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  100 
 
 		 482 aa  990    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  36.45 
 
 		 506 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  32.07 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  33.76 
 
 		 496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  29.09 
 
 		 485 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.83 
 
 		 517 aa  183  7e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  28.09 
 
 		 542 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  28.09 
 
 		 554 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  29.82 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  34.36 
 
 		 252 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.48 
 
 		 510 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  29.27 
 
 		 515 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  28.69 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.4 
 
 		 542 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.4 
 
 		 542 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.4 
 
 		 542 aa  143  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  27.91 
 
 		 537 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.58 
 
 		 613 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  30.13 
 
 		 546 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.33 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28.17 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.46 
 
 		 540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.47 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.48 
 
 		 665 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.62 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  24.69 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  29.72 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.03 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  24.87 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.43 
 
 		 541 aa  117  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  23.23 
 
 		 546 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  24.54 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  29.61 
 
 		 549 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  23.01 
 
 		 532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.54 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  27.73 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  23.71 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  24.26 
 
 		 578 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  27.4 
 
 		 534 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  25.06 
 
 		 565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  32.86 
 
 		 211 aa  114  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.52 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  30.74 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  28.8 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  27.64 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  25.13 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  24.17 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  28.7 
 
 		 597 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  27.98 
 
 		 522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.45 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  24.61 
 
 		 534 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.63 
 
 		 489 aa  109  9.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  27.51 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.02 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  21.97 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.48 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  25 
 
 		 534 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  27.44 
 
 		 519 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  27.18 
 
 		 662 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  24.48 
 
 		 537 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  24.47 
 
 		 462 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  22.04 
 
 		 525 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  26.92 
 
 		 551 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  26.9 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  27.08 
 
 		 578 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.04 
 
 		 525 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.33 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  29.25 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  27.08 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  24.48 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  21.24 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  28.11 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.48 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  24.48 
 
 		 534 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.74 
 
 		 521 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 576 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  24.58 
 
 		 569 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  24.47 
 
 		 462 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  28.93 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  28.93 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  24.22 
 
 		 534 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  26.55 
 
 		 552 aa  103  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  28.53 
 
 		 584 aa  103  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.78 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  25.3 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  20.59 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  30 
 
 		 562 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  27.97 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.31 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  25.12 
 
 		 515 aa  100  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.74 
 
 		 459 aa  100  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.49 
 
 		 520 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.56 
 
 		 426 aa  100  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.59 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  24.19 
 
 		 506 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  27.11 
 
 		 558 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.2 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  24.04 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>