56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1341 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1341  recombinase  100 
 
 		 225 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2538  recombinase  45.6 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2733  recombinase  45.57 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1686  recombinase  44.79 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0526693  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  26.34 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  36.13 
 
 		 656 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  24.44 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  34.57 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  28.57 
 
 		 516 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  28.57 
 
 		 516 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  30.77 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  25.12 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  25.12 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  32.32 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  24 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  26.54 
 
 		 475 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  34.39 
 
 		 465 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  34.51 
 
 		 548 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  34.51 
 
 		 548 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  34.51 
 
 		 548 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  24.84 
 
 		 498 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  25.41 
 
 		 518 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  25.41 
 
 		 518 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  31.86 
 
 		 548 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  25.41 
 
 		 518 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  23.41 
 
 		 517 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  27.07 
 
 		 519 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  29.7 
 
 		 598 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  26.73 
 
 		 497 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  24.23 
 
 		 515 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.88 
 
 		 484 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.95 
 
 		 484 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  30.25 
 
 		 537 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  24.04 
 
 		 518 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  33.93 
 
 		 555 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  27.64 
 
 		 524 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  34.92 
 
 		 556 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  36.25 
 
 		 485 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.93 
 
 		 546 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  29.51 
 
 		 552 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  32.32 
 
 		 583 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  24.84 
 
 		 551 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  28.41 
 
 		 504 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  24.59 
 
 		 568 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  33.08 
 
 		 575 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.19 
 
 		 487 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  31.25 
 
 		 547 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  30.82 
 
 		 386 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  27.01 
 
 		 738 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  31.34 
 
 		 524 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  23.24 
 
 		 519 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2661  hypothetical protein  32.08 
 
 		 317 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0202232  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  33.94 
 
 		 562 aa  42.4  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  29.11 
 
 		 540 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  29.71 
 
 		 565 aa  41.6  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>