199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4097 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  57.32 
 
 		 556 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  100 
 
 		 575 aa  1182    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  58.79 
 
 		 583 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  59.79 
 
 		 465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  48.32 
 
 		 548 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  48.32 
 
 		 548 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  48.32 
 
 		 548 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  46.91 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3888  Recombinase  44.28 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  0.0312397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3861  Recombinase  40.9 
 
 		 409 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3094  recombinase  41.69 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  27.92 
 
 		 598 aa  160  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  29.01 
 
 		 656 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2656  hypothetical protein  30.72 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000700215  hitchhiker  0.000699508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  26.37 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  24.76 
 
 		 519 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  25.56 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  23.71 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.46 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  27.67 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.33 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2661  hypothetical protein  36.59 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0202232  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.86 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  25.57 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  27.51 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  27.69 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  25.68 
 
 		 558 aa  77.8  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  23.08 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  27.32 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  26.59 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  27.18 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  27.18 
 
 		 532 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  26.25 
 
 		 509 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.37 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  28.35 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  23.97 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2731  Resolvase domain protein  24.4 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3150  Resolvase domain protein  24.79 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.617817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.76 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0394  Recombinase  24.91 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.018734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  23.48 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  24.74 
 
 		 551 aa  68.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  25.58 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  24.74 
 
 		 662 aa  67.4  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  21.84 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.81 
 
 		 565 aa  66.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  22.69 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.63 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  26.86 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.33 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.2 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.28 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  26.09 
 
 		 569 aa  63.5  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  23.59 
 
 		 606 aa  63.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  24.79 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  23.59 
 
 		 606 aa  63.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  24.59 
 
 		 558 aa  63.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  24.11 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0273  resolvase domain-containing protein  23.66 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.48 
 
 		 539 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  23.35 
 
 		 578 aa  62.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.75 
 
 		 484 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  22.95 
 
 		 580 aa  62  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  25.28 
 
 		 552 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.58 
 
 		 586 aa  62  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.75 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  23.51 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.87 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  23.75 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  22.47 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.22 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  32.88 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.18 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  23.87 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  22.37 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.04 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  23.39 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  30.09 
 
 		 707 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.89 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.9 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  24.79 
 
 		 601 aa  57.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  24.79 
 
 		 578 aa  57.4  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  27.7 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2129  hypothetical protein  76.47 
 
 		 106 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.84 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.52 
 
 		 551 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 542 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  24.81 
 
 		 554 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  25 
 
 		 545 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  25.37 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  28.97 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  25 
 
 		 522 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  24.21 
 
 		 552 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.89 
 
 		 540 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.47 
 
 		 534 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.32 
 
 		 506 aa  54.3  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.8 
 
 		 534 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  22.57 
 
 		 584 aa  53.9  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.37 
 
 		 546 aa  53.9  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  23.5 
 
 		 549 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>