More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3649 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  773    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  49.52 
 
 
231 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  46.57 
 
 
229 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  45.77 
 
 
216 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  45.05 
 
 
215 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  39.71 
 
 
227 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  37.04 
 
 
295 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  37.65 
 
 
283 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 
209 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 
237 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  37.16 
 
 
214 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  36.94 
 
 
217 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  39.04 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  37.44 
 
 
515 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  36.27 
 
 
190 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  36.59 
 
 
190 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  32.73 
 
 
281 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  40.88 
 
 
182 aa  87  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 
193 aa  86.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  38.75 
 
 
189 aa  86.3  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  33.49 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  34.44 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  31.08 
 
 
475 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  32.56 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  33.19 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  28.96 
 
 
459 aa  79.3  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  39.16 
 
 
236 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  36.65 
 
 
191 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 
203 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  30.36 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  34.82 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  37.14 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.7 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0512  resolvase domain-containing protein  30.09 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  29.07 
 
 
522 aa  77.4  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  34.78 
 
 
193 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  30.95 
 
 
447 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.02 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  31.32 
 
 
181 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  35.14 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  32.31 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  33.33 
 
 
465 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  29.33 
 
 
522 aa  76.3  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  35.14 
 
 
196 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  35.14 
 
 
196 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  28.19 
 
 
523 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  28.89 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.8 
 
 
522 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  35.37 
 
 
192 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 
196 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  37.45 
 
 
234 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  35.14 
 
 
196 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  35.14 
 
 
196 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  36 
 
 
183 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  34.59 
 
 
191 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.94 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  38.65 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  28.19 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  33.89 
 
 
185 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  37.5 
 
 
186 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  35.36 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  33.52 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  35 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  35.36 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  36.6 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  34.36 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  30.23 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  26.07 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  35.39 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  33.54 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  35.39 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  33.54 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  34.03 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  36.6 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  35.03 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  30.23 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  33.48 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  34.66 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.5 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.5 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.5 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  36.52 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  32.68 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  27.63 
 
 
462 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  34.6 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  29.12 
 
 
183 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  37.04 
 
 
201 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  29.12 
 
 
183 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.25 
 
 
189 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>