More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4233 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  59.49 
 
 		 198 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  42.22 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  48.17 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  42.99 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  43.3 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  43.56 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  42.41 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  41.96 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  44.14 
 
 		 268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  40.99 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  40.19 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  40.55 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  42.34 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  41.07 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  41.95 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  46.49 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  40.18 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  42.34 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  40.44 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  39.33 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  43.69 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  38.3 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  40.45 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  38.79 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  40.27 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  43.24 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  36.73 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  41.89 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  46.94 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  33.49 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  40.44 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  32.44 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  33.98 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  34.82 
 
 		 380 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  32.59 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  45.95 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  29.78 
 
 		 522 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  33.65 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  37.42 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.89 
 
 		 415 aa  72  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  31.74 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  35.37 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  34.67 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  30.87 
 
 		 513 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  33.95 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.45 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  33.93 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.29 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  34.13 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  35.23 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  35.43 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  35.71 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  35.56 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  34.19 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  33.99 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  28.07 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.64 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.42 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  34 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.54 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  35.33 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  28.38 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  31.8 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  36.77 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  37.58 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  34.23 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  36.24 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  36.24 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  35.57 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  30.04 
 
 		 665 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.9 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  29.71 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  34.23 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  33.56 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  33.56 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  34.19 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  35.57 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  35.57 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  35.48 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.89 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  34.9 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  34.9 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  35.44 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  30.77 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  33.77 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  35.17 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  36.31 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  29.51 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  33.77 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>