More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2281 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  100 
 
 		 216 aa  436  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  52.27 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  53.05 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  48.4 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  52.29 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  48.83 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  45.21 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  48.17 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  52 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  50.49 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  48.64 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  47.27 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  55.3 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  51.15 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  51.38 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  46.33 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  47.25 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  45.91 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  58.78 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  41.59 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  43.54 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  44.15 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  39.09 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  40.55 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  38.26 
 
 		 236 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  43.32 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  39.81 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  61.11 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  35.27 
 
 		 269 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  43.12 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  33.04 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  32.74 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  38.18 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  37.82 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.16 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  31.67 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.94 
 
 		 522 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.09 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  34.36 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.33 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  35.08 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  31.51 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.45 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  33.73 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  31.86 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  32.89 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  33.18 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  34.68 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.68 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.18 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  32.68 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  29.57 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  34.15 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  31.42 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  32.54 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  36.24 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  32.24 
 
 		 305 aa  65.1  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  29.13 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  28.38 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.56 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  29.52 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.56 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  36.47 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  28.38 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  28.38 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  28.38 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  33.12 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  32.97 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  36.29 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  31.41 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  36.13 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  32.24 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  32.24 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 548 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  32.24 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.16 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.16 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  35.82 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  31.63 
 
 		 537 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.46 
 
 		 515 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.5 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  28.7 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  24.34 
 
 		 547 aa  62.4  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  31.82 
 
 		 309 aa  62  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  32.37 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  32.37 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  32.37 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  31.78 
 
 		 534 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.48 
 
 		 521 aa  61.6  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  31.78 
 
 		 534 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  34.84 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.06 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>