More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2499 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  97.81 
 
 		 229 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  57.78 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  53.95 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  52.23 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  57.33 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  50.87 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  48.47 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  48.64 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  46.36 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  48.72 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  46.49 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  45.29 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  49.78 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  48.23 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  45.62 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  59.59 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  43.1 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  43.48 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  44.1 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  43.3 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  48.2 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  40.62 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  43.23 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  39.38 
 
 		 248 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  40.2 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  39.09 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  38.67 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  59.86 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  39.09 
 
 		 197 aa  118  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  36.24 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  34.35 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  35.32 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  38.35 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  30.43 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  37.66 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  39.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  32.35 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  32.35 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  31.2 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  29.25 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  34.84 
 
 		 190 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  31.3 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  31.84 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  32.02 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  34.18 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  32.99 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  35.53 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  37.5 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  28.27 
 
 		 522 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  32.69 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.87 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.76 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  34.84 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  35.06 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  33.96 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  32.88 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  32.88 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  34.18 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  32.47 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  34.72 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  34.72 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  34.72 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  31.28 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.16 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.31 
 
 		 665 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.49 
 
 		 546 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  37.67 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  34.81 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  34.44 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  33.55 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  33.55 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  32.9 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.94 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  32.91 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  33.55 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  33.55 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  28.45 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  30.57 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  31.65 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  33.96 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  36.54 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  36.54 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  32.69 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  35.62 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.01 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.01 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.01 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  34.06 
 
 		 474 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.39 
 
 		 515 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  34.42 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  29.5 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  29.5 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  31.22 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>