More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7497 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  92.04 
 
 		 233 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  65.77 
 
 		 248 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  55.14 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  60.35 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  52.99 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  51.27 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  47.58 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  52.86 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  47.39 
 
 		 227 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  45.91 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  42.17 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  43.48 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  51.98 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  41.99 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  43.04 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  43.81 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  44.35 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  45.25 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  44.1 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  40.36 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  41.52 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  56.16 
 
 		 150 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  41.33 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  50.33 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  45.95 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  40.64 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  41.05 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  33.76 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  43.04 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  49.78 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  33.05 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  35.19 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  35.59 
 
 		 665 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  40.14 
 
 		 197 aa  92.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  33.33 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  34.57 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  33.76 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  33.73 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  32.3 
 
 		 613 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  36.09 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  33.19 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  32.52 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  33.04 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  36.65 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.2 
 
 		 494 aa  72  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  32.76 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  36.16 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.8 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.56 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  34.25 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.01 
 
 		 522 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  34.25 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  31.67 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  25.78 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  27.35 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.01 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.88 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.07 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.01 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  25.56 
 
 		 542 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  35.15 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  29.02 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  35.15 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  32.12 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  33.96 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  33.96 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  36.03 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  33.91 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  35.22 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  31.94 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  31.94 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  31.94 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.18 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  34.25 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3386  hypothetical protein  48.54 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  33.11 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.05 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  31.06 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.53 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  37.11 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  37.66 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  37.11 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2383  resolvase domain-containing protein  63.04 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  34.84 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  34.94 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  27.51 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.99 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  34.87 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  34.87 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  31.6 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  33.67 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  33.67 
 
 		 326 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  35.8 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  32.91 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>