40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3786 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  100 
 
 		 242 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  92.98 
 
 		 242 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  73.22 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  38.21 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  34.02 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  32.38 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  31.82 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  28.86 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  30.96 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  29.83 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  32.93 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  34.01 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  29 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  29.39 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  28.98 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  29.69 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  30.89 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  29.75 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  32.65 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  29.13 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  30.83 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  34.88 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  26.18 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  31.67 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  25.75 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  29.67 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  28.15 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  30.45 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  34.31 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  36.43 
 
 		 150 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  26.97 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  28.96 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2383  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 83 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  28.08 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  26.78 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  26.25 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  33 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  31.82 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  38.28 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>