31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1154 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  33.49 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  30.3 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  30.84 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  27.6 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  29.24 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  28.44 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  27.98 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  26.36 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  30.14 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  25.66 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  28.51 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  25.69 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  28.38 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  26.32 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  28.95 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  26.22 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  30.33 
 
 		 269 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  29.03 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  29.74 
 
 		 264 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  31.82 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  31.51 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  30.28 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  28.83 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  33.79 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  30.64 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  25.23 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  31.15 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2383  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 83 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>