41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3478 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  92.98 
 
 		 242 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  72.8 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  38.62 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  34.02 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  33.61 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  30.34 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 269 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  30.43 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  30.04 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  28.92 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  30.33 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  29.58 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  32.93 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  34.02 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  30.77 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  30.58 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  32.52 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  37.98 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  32.92 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  28.99 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  29.57 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  26.25 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  29.67 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  31.38 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  33.55 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  26.18 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  49.02 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  27.8 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2383  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 83 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  35.66 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  26.94 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  27 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  28.97 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  27.17 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  31.1 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  38.28 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 340 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 380 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>