299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0275 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  58.04 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  49.09 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  53.81 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  50.22 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  48.4 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  49.13 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  47.16 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  51.1 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  46.49 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  45.61 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  46.49 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  43.12 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  47.11 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  44.54 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  44.83 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  41.92 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  47.27 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  41.26 
 
 		 214 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  41.74 
 
 		 268 aa  157  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  40.61 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  42.31 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  41.96 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  51.72 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  37.55 
 
 		 269 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  42.92 
 
 		 231 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  37.28 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  40.98 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  35.09 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  42.99 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  35.19 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  40.58 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  36.02 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  38.8 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  33.33 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  35.04 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  35.24 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  35.62 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  28.51 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  29 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  30.53 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.13 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  33.54 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  33.19 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  27.65 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  32.26 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  29.29 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  29.29 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  29.29 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  41.59 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  32.3 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  35.57 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  40.71 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  30.86 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  30.86 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  29.49 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.83 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  31.07 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.3 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  34.12 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  34.42 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  33.55 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  33.33 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  31.13 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  32.21 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  29.23 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  31.11 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  33.56 
 
 		 184 aa  62  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  34.9 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  32.67 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  32.88 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  32.14 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  28.66 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  32.19 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  35.57 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  30.57 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  33.99 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  33.99 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  33.99 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  28.66 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  32 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  32.19 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  29.23 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  32.84 
 
 		 580 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.81 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  35.81 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  33.58 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  33.54 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.81 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  28.66 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  37.78 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  31.33 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>