More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1223 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  67.41 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  61.88 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  57.33 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  56.89 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  57.46 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  58.26 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  51.1 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  62.05 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  52.44 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  51.38 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  53.54 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  59.11 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  52.19 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  52.86 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  51.98 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  47.77 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  51.15 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  51.58 
 
 		 268 aa  175  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  64.43 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  49.56 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  45.09 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  41.06 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  52.47 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  47 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  57.52 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  41.89 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  46.26 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  47.53 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  39.47 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  36.24 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  45.92 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  38.67 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  36.52 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  36.91 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  42.23 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  38.08 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  36.09 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  45.57 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  41.33 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  37.95 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  34.29 
 
 		 242 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  33.47 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  38.77 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  38.51 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  38.03 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  28 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.08 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.08 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.08 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  33.96 
 
 		 474 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  37.32 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  37.32 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  38.51 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 510 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  30.97 
 
 		 613 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  44.44 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  29.6 
 
 		 665 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  38.78 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  32.47 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  36.88 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  26.67 
 
 		 500 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  30.09 
 
 		 484 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.84 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.84 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.84 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  35.95 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  30.09 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  39.29 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  32.59 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  40.13 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  36.67 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  36.24 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  33.78 
 
 		 534 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  41.23 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  31.58 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  32.31 
 
 		 460 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  36 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  31.58 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  38.26 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  33.77 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  37.33 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  33.13 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.56 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  35.09 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  32.91 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  40.41 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  28.48 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  34.39 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  29.38 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.42 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.01 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  34.94 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.24 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>