80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3788 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  544  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  55.14 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  53.5 
 
 		 233 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  45.27 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  46.56 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  42.91 
 
 		 236 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  40.16 
 
 		 228 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  44.86 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  39.18 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  40.16 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  44.13 
 
 		 227 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  37.55 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  36.48 
 
 		 225 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  39.09 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  38.68 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  37.65 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 		 150 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  35.27 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  35.42 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  37.45 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  34.96 
 
 		 219 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  37.19 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  36.73 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  38.11 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  36.93 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  40.08 
 
 		 231 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  36.4 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  45.52 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  29.41 
 
 		 236 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  35.54 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  30.83 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  30.77 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  32.52 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  39.75 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  28.86 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  27.98 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  33.65 
 
 		 198 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  37.58 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  27.64 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  31.94 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2383  resolvase domain-containing protein  67.39 
 
 		 83 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  28.57 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  30.83 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  29.15 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  27.89 
 
 		 521 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  38.41 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  38.3 
 
 		 183 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  38.3 
 
 		 183 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  27.38 
 
 		 460 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  38.04 
 
 		 187 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  32.35 
 
 		 181 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  29.88 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  29.58 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  28.69 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3386  hypothetical protein  50 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  30.92 
 
 		 216 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  32.89 
 
 		 187 aa  48.9  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  34.21 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 521 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.16 
 
 		 665 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.21 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  34.31 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  33.56 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  31.72 
 
 		 546 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  28 
 
 		 513 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  31.37 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  31.37 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  31.37 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.74 
 
 		 540 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  31.91 
 
 		 184 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8748  resolvase domain-containing protein  51.16 
 
 		 51 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  31.69 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  30.28 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  30.37 
 
 		 513 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  26.22 
 
 		 523 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  32.61 
 
 		 224 aa  42  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  28.08 
 
 		 200 aa  42.4  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  27.41 
 
 		 500 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>