More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3483 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  49.09 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  45.21 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  46.82 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  48.17 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  48.18 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  46.36 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  46.36 
 
 		 229 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  43.81 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  44.95 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  47.96 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  40.09 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  47.73 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  41.52 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  42.99 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  47.77 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  46.12 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  46.58 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  39.29 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  39.44 
 
 		 237 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  37.5 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  40.72 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  39.21 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  40.36 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  49.65 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  37.83 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  35.78 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  41.58 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  40 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  35.4 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  34.96 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  44.34 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  34.05 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  36.24 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  31.88 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  43.62 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  40.54 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  38.62 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  38.62 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  38.62 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  30.22 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  40 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  33.54 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  33.54 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.93 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  29.65 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  33.04 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  29.73 
 
 		 515 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  37.75 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  35.92 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  36.08 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  35.14 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  28.76 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.3 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  29.39 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  29.33 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  38.51 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  38.51 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  33.78 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.51 
 
 		 522 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.72 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  34.46 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  25.64 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  35.42 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  34.36 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  31.47 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5214  hypothetical protein  41.84 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  36.24 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0274  resolvase domain-containing protein  22.94 
 
 		 580 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  35.95 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  33.33 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  32.47 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  25.64 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  36.49 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.07 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  35.81 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.05 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  31.03 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  36.42 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  35.76 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  35.76 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  35.76 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  25.44 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  34.48 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  32.64 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  34.46 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  37.75 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.74 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.46 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  37.75 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  24.34 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>